重癥醫(yī)學領(lǐng)域的發(fā)文利器“MIMIC”還有誰不知道?。。?/a>
對于臨床醫(yī)生來說，每天不光需要加班加點的辛苦工作，還要做出科研成績，評職稱、發(fā)文章的壓力說來就來。這讓本來就不太快樂的生活更加雪上加霜了。放寬心，別害怕，除了做基礎實驗外，咱也可以通過收集數(shù)據(jù)發(fā)文章。什么？本來就已經(jīng)很忙了，還要自己收集數(shù)據(jù)？NO，咱們想說的是收集公共收據(jù)庫的數(shù)據(jù)，做自己的研究。今天要介紹的這個發(fā)文利器叫做“MIMIC”，一起來看看到底怎么回事兒吧。
MIMIC數(shù)據(jù)庫全稱The Medical Information Mart for Intensive Care?，是一個大型的、可自由使用的臨床重癥醫(yī)學數(shù)據(jù)庫，其中包括從貝思以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心的急診室接收的病人那里獲得的與健康有關(guān)的數(shù)據(jù)。網(wǎng)址：https://mimic.mit.edu/。
小編在pubmed上檢索關(guān)鍵字，結(jié)果發(fā)現(xiàn)僅僅2023年不到一年的時間，就產(chǎn)出了接近600篇的文章量，可見這個公共數(shù)據(jù)庫還是很有挖掘潛力的。
根據(jù)MIMIC數(shù)據(jù)庫官網(wǎng)顯示，MIMIC目前已經(jīng)更新了MIMIC Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ三個版本，其數(shù)據(jù)來源由兩個不同的臨床信息系統(tǒng)收集的數(shù)據(jù)組成:CareVue和MetaVision。
三個版本的不同在于：
1.MIMIC-IV包含2008-2019年的數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)來自Metavision床旁監(jiān)護儀。
2.MIMIC-III包含2001 -2012年的數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)來源于Metavision和CareVue床旁監(jiān)護儀。
3.MIMIC-II包含2001-2008年的數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)來自CareVue床旁監(jiān)護儀。MIMIC-II現(xiàn)已不再公開使用，但仍可通過從MIMIC-III獲取僅包括來自CareVue監(jiān)視器的數(shù)據(jù)。
MIMIC基本的數(shù)據(jù)處理代碼也可以從官方的Github上找到。
在這里我們主要介紹一下最新的MIMIC-IV：
MIMIC-IV是一個關(guān)系數(shù)據(jù)庫，包含美國馬薩諸塞州波士頓一家三級學術(shù)醫(yī)療中心收治的患者的真實住院時間。MIMIC-IV包含每個患者住院期間的全面信息：實驗室測量值、給予的藥物、記錄的生命體征等。該數(shù)據(jù)庫旨在支持醫(yī)療保健領(lǐng)域的各種研究。MIMIC-IV建立在MIMIC-III的基礎上，并對MIMIC-III進行了許多改進。該數(shù)據(jù)庫的使用得到了麻省理工學院和貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心的機構(gòu)審查委員會的批準。該項目符合《赫爾辛基宣言》，由于參與者的匿名性和該數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)標準化，使用者不需要得到倫理委員會的批準。
MIMIC-IV數(shù)據(jù)庫被分成多個“模塊”，以反映數(shù)據(jù)的來源。目前有五個模塊：
那么落到實處，該怎么利用這個數(shù)據(jù)庫來實現(xiàn)SCI文章的產(chǎn)出呢，我們來看一篇今年7月份由暨南大學附屬第一醫(yī)院腎內(nèi)科發(fā)表的文章。
Aspirin reduces the mortality risk of sepsis-associated acute kidney injury: an observational study using the MIMIC IV database
IF=5+
研究背景
膿毒癥是宿主對感染的失控反應，如不及時治療，可能導致嚴重的器官衰竭。有40%-50%的膿毒癥患者表現(xiàn)為急性腎損傷，即膿毒癥相關(guān)的急性腎損傷（SA-AKI），這是膿毒癥最常見和最嚴重的并發(fā)癥之一。阿司匹林是一種廣泛使用的藥物，具有解熱、鎮(zhèn)痛和抗炎特性，因為其對環(huán)氧合酶的作用，在炎癥、止血和免疫調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用。膿毒癥被認為是一種對病原體的炎癥和促凝反應失調(diào)，血小板與內(nèi)皮細胞相互作用，調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)。阿司匹林可抑制血小板功能，減輕炎癥反應，從而改善預后。而阿司匹林是一種特殊的抗血小板藥物，因為不同劑量的阿司匹林具有不同的功能。低劑量阿司匹林（75-100 mg/d）具有抗血小板作用，大劑量阿司匹林（>300 mg/d）除具有抗血小板作用外，還具有抗炎作用。以前的研究沒有考慮到在膿毒癥患者中服用阿司匹林的最佳劑量，且先前的研究集中于低劑量阿司匹林對膿毒癥患者的影響。因此，作者對MIMIC-IV數(shù)據(jù)庫進行了分析，以調(diào)查使用阿司匹林與SA-AKI患者預后之間的相關(guān)性，并確定阿司匹林治療的最有效劑量。
數(shù)據(jù)來源
文章數(shù)據(jù)來源于MIMIC-IV數(shù)據(jù)庫。作者從數(shù)據(jù)庫中收集了臨床數(shù)據(jù)，包括患者人口統(tǒng)計信息、實驗室檢查結(jié)果和藥物治療。
納入和排除標準
在這些膿毒癥患者中，選擇了基于腎臟疾病改善整體預后（KDIGO）標準的AKI患者作為研究對象。用SCr和尿量對AKI的分期進行分類。排除標準為：1) ICU住院時間<48h（出院或死亡）；2）年齡< 18歲的患者。將在醫(yī)院接受阿司匹林治療的SA-AKI患者與未接受藥物治療的患者進行比較。
使用SQL從Navigate Premium（版本16）中的MIMIC-IV2.1中獲取患者信息，包括包括年齡、性別和種族。此外，在患者住院后立即測量生命體征，包括收縮壓、舒張壓、心率和氧飽和度（SpO2）。代碼來自https://github.com/MIT-LCP/mimic-iv/concepts_postgres。此外，在患者住院后立即測量生命體征，包括收縮壓、舒張壓、心率和氧飽和度（SpO2）。記錄以下SA-AKI共?。焊哐獕骸⑻悄虿『托呐K手術(shù)。隨后，提取入院第一天內(nèi)的實驗室指標，包括血紅蛋白、白細胞、血小板、葡萄糖、凝血酶原時間和尿量。計算ICU入院時的SOFA評分和GCS評分。并且注意到以下治療信息：使用機械呼吸、血管升壓藥和腎臟替代治療。
研究結(jié)果
1.本研究的工作流程圖：
介紹了目前研究中的患者選擇程序，共有12,091例SA-AKI患者符合納入標準。12091例SA-AKI患者的詳細臨床信息包括開始時間、結(jié)束時間、阿司匹林治療劑量。
2.患者特征
本項研究是一項回顧性研究，其結(jié)果很容易受到混雜因素的影響。傾向評分匹配（PSM）是一種常用的減少混雜因素影響的方法，它是使用傾向評分來匹配實驗組個體中與對照組具有相同或相似背景特征的個體。從MIMIC-IV數(shù)據(jù)庫中提取12091例SA-AKI患者，7694個個體被傾向評分匹配（PSM）匹配。PSM后，混雜因子干擾最小，主要因素是阿司匹林。表1為兩組傾向評分匹配（PSM）前后SA-AKI患者的臨床信息。
3.阿司匹林與死亡率的關(guān)系
SA-AKI患者根據(jù)住院期間是否接受阿司匹林治療，可分為兩組。通過單變量cox風險分析，阿司匹林組30和90天死亡率風險低于非使用者組，如表2。30天生存率的Kaplan-Meier曲線如圖2所示，90天生存率的曲線如圖3所示。根據(jù)Kaplan-Meier生存分析，阿司匹林使用者組的30天生存率和90天生存率均顯著高于非使用者組。并且接受阿司匹林治療的患者的中位生存時間明顯長于未接受阿司匹林治療的患者（46.47天vs. 24.26天），如表2。
4.阿司匹林與復合結(jié)果的相關(guān)性
阿司匹林組平均ICU持續(xù)時間較短，兩組間胃腸道出血率差異無統(tǒng)計學意義，如表3。
5.亞組分析
SA-AKI患者根據(jù)年齡、性別、種族、AKI分期、共病率、SOFA評分、GCS評分、腎臟替代治療（RRT）和血管活性藥物分為不同的亞組。作者研究了阿司匹林對SA-AKI亞組90天死亡率的影響，結(jié)果顯示為森林圖，如圖4。
6.阿司匹林的劑量
前列腺素環(huán)加合酶有兩種亞型：COX-1和COX-2。低劑量阿司匹林是一種更有效的COX-1抑制劑，因此可以抑制血小板活化，而高劑量阿司匹林同時抑制COX-1和COX-2依賴的前列腺素生成。為了進一步探討阿司匹林治療的最佳劑量，采用Cox比例風險模型分析了阿司匹林治療劑量與90天死亡率之間的關(guān)系。住院使用阿司匹林的SA-AKI患者按阿司匹林劑量分為不同組。與低劑量（≤300 mg/d）阿司匹林相比，高劑量（>300 mg/d）阿司匹林組的90天死亡率風險較低，如表4。Cox比例風險模型如圖5所示。因此，對于SA-AKI患者，高劑量阿司匹林可能比傳統(tǒng)的低劑量阿司匹林更可取。
文章小結(jié)
阿司匹林可能會降低SA-AKI患者的ICU平均持續(xù)時間和30天或90天的死亡風險，且阿司匹林組與非阿司匹林組之間的胃腸道出血率無顯著性差異，因此阿司匹林可能是SA-AKI一種有效的藥物。然而，阿司匹林對SA-AKI患者有益的具體機制有待進一步研究。
END
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