分辨率
分辨率(Resolution)是指質(zhì)譜儀區(qū)分兩個(gè)質(zhì)量相近的離子的能力。
計(jì)算公式:R=m/?m
計(jì)算方法有兩種:
- 10%谷圖:假設(shè)兩個(gè)相鄰的等高峰M1和M2,M2為M1+△M,它們彼此靠近到這樣的程度以致相重疊的谷高度為峰高(h)的10%。
-
50%峰寬(FWHM):質(zhì)量為M的峰與該峰半高度處的峰寬之比。
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分辨率越高,同一物質(zhì)采集的分子量的峰的精細(xì)程度越大,準(zhǔn)確度越高。

但是,分辨率設(shè)置越高,掃描所需的時(shí)間越長。所以,要同時(shí)兼顧分辨率和掃描速度。
一般大規(guī)模組學(xué)數(shù)據(jù), Thermo公司的orbitrap系列儀器,一般一級分辨率設(shè)置在70000左右,能夠精確分辨小數(shù)點(diǎn)后兩位。
準(zhǔn)確度
準(zhǔn)確度(accuracy)指離子測量的準(zhǔn)確性。一般用真實(shí)值和測量值之間的誤差來評價(jià),單位ppm (part per million)。主要取決于質(zhì)量分析器的性能和分辨率的設(shè)置。

目前對于做組學(xué)的常用儀器,AB5600或Q Exactive 等質(zhì)譜儀,質(zhì)量分析器TOF或Orbitrap都可達(dá)到10ppm以下的誤差級別。所以實(shí)際中質(zhì)譜鑒定時(shí)常見的一級質(zhì)量容差設(shè)置為20ppm,二級質(zhì)量容差為0.1Da等,已遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于儀器的誤差。
靈敏度
靈敏度(sensitivity)是指檢測器對一定樣品量的信號響應(yīng)值,即最少樣品量的檢出程度。
一般對于純的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)而言,靈敏度可達(dá)到fmol級別。
但是,高的靈敏度不一定能檢測到目標(biāo)蛋白,一是樣品本身信息量大,DDA模式中只有信號響應(yīng)高的物質(zhì)才能檢測到;二是肽段離子化才能采集數(shù)據(jù),離子化效率低,可能在傳輸過濾中過濾掉。
Orbitrap系列常規(guī)參數(shù)

關(guān)于Mass error
ppm,即百萬分之一,如果質(zhì)譜檢測極限在1ppm,就表示能檢測含量在百萬分之一的物質(zhì)。
Da,指原子質(zhì)量單位,如 C 就是12Da。mDa,一般在高分辨質(zhì)譜儀上有這個(gè)參數(shù),表示質(zhì)譜的分辨率。
質(zhì)量測量準(zhǔn)確度
質(zhì)量測量準(zhǔn)確度是質(zhì)譜定性的重要依據(jù)。其表示方法如下:
(|M-M0|÷m)×10^6(ppm)
公式中,M為離子質(zhì)量的實(shí)測值;M0為離子質(zhì)量的理論值;m為離子的質(zhì)量數(shù)。例如,某化合物分子離子實(shí)測值為364.2504,理論值為364.2509,質(zhì)量測量準(zhǔn)確度為:|364.2504 - 364.2509|÷ 364×10^6=1.4 ppm
有時(shí)質(zhì)量測量準(zhǔn)確度也以mmu(毫質(zhì)量單位)表示,表示式為|M - M0|(mmu)
對于高分辨率質(zhì)譜通常要求儀器的質(zhì)量測量準(zhǔn)確度小于1mmu(或10 ppm),才能滿足定性分析的需要。
