- Perl是一門解釋性語言
- Perl的包管理工具:cpan,cpam
- Perl的手動安裝方法
裝Perl模塊有兩種方法:
- 自動安裝:CAPN,CPANM
- 手動安裝(去CPAN網(wǎng)站下載所需要的模塊,手工編譯、安裝)
- 推薦閱讀:perl模塊安裝大全
Trinitiy中Perl的作用
- 命令行參數(shù)解析
- 流程銜接
- 輸出格式解析
# 服務器上下載異常的慢,先下載到本地,再用winscp上傳,快很多
# 解壓縮—make編譯—
vip39@VM-0-15-ubuntu:~/src$ cd Trinityrnaseq-v2.6.6/
vip39@VM-0-15-ubuntu:~/src/Trinityrnaseq-v2.6.6$ make
# 如何使用,去官網(wǎng)看看使用方法吧
conda的Perl會和系統(tǒng)的Perl沖突
- 原因:
conda添加到環(huán)境變量后,conda的Perl取代了系統(tǒng)的Perl
之前安裝Perl模塊要么找不到,要么與conda的Perl沖突 - 解決方法:
不要將conda添加到環(huán)境變量中
解決方法:https://mp.weixin.qq.com/s/PkbM98OteU5xhhsjelBtSw