在構(gòu)建動(dòng)物模型時(shí)，需要考慮影響牛和性狀的效應(yīng)：

• 1 時(shí)間和位置 - 固定效應(yīng)
  (1) 時(shí)間上：環(huán)境改善或變壞（太多月或者太熱）；飼料質(zhì)量和數(shù)量隨時(shí)間改變； 分類可以采用星期，月，年（可以根據(jù)產(chǎn)犢時(shí)間）。但是需要確保每個(gè)類別中具有足夠的牛數(shù).
  (2) 如果數(shù)據(jù)收集來(lái)自動(dòng)物地區(qū)（分布很廣），則應(yīng)該也考慮位置效應(yīng)
  一般采用兩者進(jìn)行交叉： 產(chǎn)犢季節(jié)x年x位置

-2 臨時(shí)分組 - 隨機(jī)效應(yīng)
一般是考慮： 牛場(chǎng)（herd，代表管理系統(tǒng)） x 產(chǎn)犢年(calving year). 動(dòng)物在不同群體不同年份飼養(yǎng)。如果想要更細(xì)分，可以將產(chǎn)犢年改為產(chǎn)犢季節(jié)或產(chǎn)犢月份
當(dāng)然，對(duì)于犢牛進(jìn)行斷奶，和公，母分開飼養(yǎng)，也可能加入其中：herd x calving year x management
當(dāng)然也有： herd x calving year x calving season 當(dāng)做固定效應(yīng)，氮使用herd在calving year x calving season可能沒有意義，如果數(shù)據(jù)為20或30年的數(shù)據(jù). 如果為短時(shí)間收集的數(shù)據(jù)，則可行。
但是在將herd x calving year 作為隨機(jī)效應(yīng)后，不能再將herd x calving year x season 作為固定效應(yīng)

• 3 與時(shí)間交互的固定效應(yīng)
  305天產(chǎn)奶量可能隨著母牛的產(chǎn)奶年齡發(fā)生變化，隨意一般也會(huì)對(duì)這類性狀，考慮calving age，這可能是隨著時(shí)間改變，飼料發(fā)生了改變。
  模型應(yīng)該被認(rèn)為是動(dòng)態(tài)的和不斷發(fā)展的，而不是多年或幾代人的靜態(tài)。

• 4 加性遺傳效應(yīng) - 隨機(jī)效應(yīng)
  最初假設(shè)，動(dòng)物需要隨機(jī)交配，但是因?yàn)閷?duì)動(dòng)物進(jìn)行育種，這個(gè)假設(shè)時(shí)不成立的。

需要完整的關(guān)系矩陣來(lái)描述這個(gè)關(guān)系。
但是因?yàn)镚S對(duì)犢牛的提前選擇，會(huì)使隨機(jī)交配產(chǎn)生更大偏差

需要注意對(duì)未知父母分組。
對(duì)于老數(shù)據(jù)的使用

• 5 永久環(huán)境效應(yīng) - 隨機(jī)效應(yīng)
  當(dāng)一個(gè)性狀在一個(gè)泌乳期或短時(shí)間測(cè)量多次的話，可以估計(jì)其永久環(huán)境效應(yīng)。其在實(shí)際中最常用。
  但是環(huán)境一般不是不變的， 在動(dòng)物模型中應(yīng)使用累積環(huán)境影響而不是永久環(huán)境影響。