參考資料:https://zhuanlan.zhihu.com/p/109261289
表觀遺傳學(xué):
研究基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因表達(dá)的可遺傳的變化。目前已知的有DNA甲基化,基因組印記,母體效應(yīng),基因沉默,核仁顯性,休眠轉(zhuǎn)座子激活和RNA編輯等。
DNA甲基化:
生物體在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,以S-甲硫氨酸為甲基供體,將甲基轉(zhuǎn)移到特定的堿基上的過程。即保護(hù)DNA使基因無法被轉(zhuǎn)錄。
甲基化常用方法:
1、重甲硫酸鹽測(cè)序,目前最準(zhǔn)確最常用的方法,可做全基因組甲基化測(cè)序,但是步驟繁瑣價(jià)值較高。
2、甲基化DNA免疫共沉淀MeDIP-Seq,基于抗體富集原理進(jìn)行測(cè)序,到那時(shí)一般都是富集部分關(guān)心區(qū)域。
3、三代測(cè)序技術(shù),對(duì)DNA聚合酶的工作狀態(tài)進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)yingguang的方法。
CpG島: CpG是5‘-C-磷酸-G-3’ 的簡(jiǎn)寫,CpG島是具有高頻率CpG位點(diǎn)的區(qū)域,即GC這樣的堿基連續(xù)的出現(xiàn)再DNA片段上,因?yàn)檫@些片段多位于基因的啟動(dòng)子區(qū)域,就意味著這些區(qū)域一旦發(fā)生甲基化,就不能啟動(dòng)基因表達(dá)。
實(shí)驗(yàn)原理:
DNA + 重硫酸鹽 ===> C--C(甲基化)/ C--U(非甲基化)+ PCR ===> C--C/U--T