學習小組Day3-1筆記-- Joanna

在linux環(huán)境下的軟件安裝實操

    1. 安裝過程


      image.png

      一番倒騰后，安裝成功了


      image.png

  • 2.激活過程


    image.png

    1. 建立conda主網(wǎng)站的副本


      image.png

    1. 查看conda的明細


      image.png

    1. 安裝軟件


      image.png

      image.png

【-y是yes，安裝過程中conda問你的問題全部回答yes，你可以試試不加-y有什么區(qū)別】
我覺得區(qū)別就是-y表示都默認了yes安裝，沒加的話可能得收到去敲入yes吧。。哈哈 ，因為好不容易才走到這步，不好輕易嘗試，萬一???有bug就尷尬了～～等回頭自己玩的比價溜的時候再試、、

老版本的軟件安裝


image.png

    1. 確認fastqc軟件是否安裝成功


      image.png

    1. 卸載軟件 fastqc


      image.png

      不知為何，沒辦法順暢地完成

選修

  • 查看conda環(huán)境
    conda info --envs


    image.png
  • 建立一個名叫rnaseq的conda環(huán)境

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y


image.png
  • 檢查下是是否創(chuàng)建上述新環(huán)境成功

conda info --envs


image.png
  • 激活新的conda環(huán)境

conda activate rna-seq


image.png

  • 嘗試了下能否正常運行


    image.png
  • 退出當前環(huán)境

conda deactivate
![image.png](https://upload-images.jianshu.io/upload_images/23256278-73ec1c7b007537ab.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/124

PS 當出現(xiàn)登陸不上服務器時，一定要查看源頭。。。是不是網(wǎng)絡(luò)不行了怎么的，特別是用校內(nèi)外、院內(nèi)網(wǎng)等。。哎。折騰了大半天才登陸上去。必須Mark下登陸上去的一刻～～

image.png

最后編輯于 ：
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成，瀏覽時請結(jié)合常識與多方信息審慎甄別。
平臺聲明：文章內(nèi)容（如有圖片或視頻亦包括在內(nèi)）由作者上傳并發(fā)布，文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點，簡書系信息發(fā)布平臺，僅提供信息存儲服務。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容