更實(shí)用!批量解析 Sanger 測序.ab1文件~出圖出文本

寫在前面

年前,推了兩個插件,主要針對基因克隆實(shí)驗(yàn)中常見需求,即引物設(shè)計(jì)以及Sanger測序結(jié)果解讀....(主要還是為了情懷,都是我接觸生信之前一直想要的功能...),對應(yīng)了三個推文:

  1. 《實(shí)用 | PCR 引物特異性?用Primer Check檢測一下》
  2. 《眼見為實(shí)!Sanger測序峰圖比對到參考序列 - 直觀!》
  3. 《有點(diǎn)意思!Sanger 測序峰值圖自動解析單倍型》

其中最后一個推文事實(shí)上,是在「TBtools」老鐵使用過之后做了增強(qiáng)。轉(zhuǎn)眼兩周過去了。萬萬沒想到,不少濕實(shí)驗(yàn)的朋友過年期間一直在加班干實(shí)驗(yàn)。今天下午,收到南農(nóng)和老師的反饋信息,主要建議增加一個批量模式,主要原因是,往往基因編輯的結(jié)果材料有幾十上百株系,而不僅僅是三五個...原本相關(guān)工作需要數(shù)天,有了插件可能還需要三四天,但如果支持批量模式,那么....
完全在理。收到這個反饋信息的時候,我突然覺得「TBtools」工作確實(shí)沒做到位。開發(fā)「TBtools」的出發(fā)點(diǎn)在于減少濕實(shí)驗(yàn)科研人員在數(shù)據(jù)分析上的時間投入,讓大伙更多陪伴家人
稍微遲疑了一會,采納了和老師的建議,并做了簡單調(diào)整,于是得到新版插件,暫時略去交互分析,重在批量處理。

Batch Sanger Sequencing Result Check

新插件的界面如下:



相關(guān)使用簡單,直接給個示例



運(yùn)行結(jié)束后,可以在設(shè)置的輸出目錄中看到輸出文件,大體如下

感覺不錯~

寫在最后

Emmm.... 正如前述,

  1. 一個好用的工具,常常用戶很多;
  2. 而用戶很多的工具,常常才會是好用的工具。

PS: 「生信藥丸」上不時會恰飯,后臺留言有不少意見....大伙可以有意見,但飯就是要恰,沒得商量。

差點(diǎn)忘了....

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