在司令部淪陷后，2B和2S掩護著司令在司令部中殺出一條血路，面對曾經(jīng)的隊友，2B卻不得不痛下殺手，好不容易到了停機場，當2B和9S打算帶著司令離開的時，司令卻拒絕離開。
司令眼里閃爍著詭異的紅光，原來司令也已經(jīng)被病毒感染了，時間緊迫，9S根本沒有時間幫司令解決病毒，只能眼睜睜的看著司令與整個寄葉部隊在寂靜的太空站化作絢爛的煙花。2B和9S迫降后墜落在了不同的地點，整個故事的節(jié)奏也在這一刻進入完全不同的節(jié)奏，落到地面的2B發(fā)現(xiàn)自己在之前的戰(zhàn)斗中也感染了病毒，自我保護程序完全沒有作用，不斷前進，卻只能眼睜睜的看著感染進度一步步加深，最終倒在了9S的視野內(nèi)，在殘留意識的最后一刻，2B遇到了A2，她希望A2殺掉她，并接收她的記憶，故事開端的謎題也再次揭曉。2B的真實型號并不是2B，而是2E,2B的真實任務是監(jiān)視9S，因為9S機型的特殊性，非常可能覺醒感情，也非常容易起疑心，進而知道整個計劃的真相，每當9S有感情表現(xiàn)的時候，2B都會殺掉9S，重置9S的黑盒數(shù)據(jù)。所以2B和9S早已不是第一次見面，9S卻一次又一次愛上2B，而當迫降的9S趕到2B身邊的時候，看到的卻是2B死在A2手中的那一刻......
A2在之后與9S的一次見面，告訴了9S真相，9S卻表示哪又如何，與繼承了2B記憶而對9S有著好感的A2不同，在9S眼中，A2只是殺掉2B的兇手，他對A2只有無盡的恨。
