
T細胞生物學(xué)的進展揭示了T細胞群體的異質(zhì)性,而這種異質(zhì)性無法用現(xiàn)有的通用命名法來描述。這個問題導(dǎo)致了核心T細胞亞群定義的隨意擴展,以及一些新的亞群名稱的出現(xiàn),而這些名稱并未得到統(tǒng)一的界定。為了解決這個問題,我們在本共識聲明中提出了旨在實現(xiàn)三個目標的指導(dǎo)原則。首先,這些原則倡導(dǎo)原始研究報告在每項研究的方法部分明確定義相關(guān)亞群的實驗依據(jù)。其次,這些原則為常用的現(xiàn)有亞群名稱提供標準化定義,并指出定義每個亞群的常用實驗標準。最后,這些原則提出了一種替代性的“模塊化命名法”范式。新提出的模塊化命名法摒棄了將抗原經(jīng)歷的T細胞概念化為屬于少數(shù)理想化亞群的做法,而是用簡短的描述符來指代T細胞群體中存在的個體生物學(xué)特性??偠灾?,這些指導(dǎo)原則旨在提高文獻的透明度,同時促進研究人員、學(xué)生和臨床醫(yī)生更清晰地了解研究結(jié)果和概念。
20世紀60年代,淋巴細胞首次被分為兩大亞群:B細胞和T細胞。這一分類并非毫無爭議;最初有人公開指出,B和T分別是“bullshit”(胡說八道)的首尾字母。20世紀70年代,T細胞根據(jù)其表達的T細胞受體(TCR)的CD4或CD8共受體,被進一步分為兩類:CD4+T細胞和CD8+T細胞。所有這些細胞群都可以被恰當(dāng)?shù)囟x為不同的細胞類型,因為在生理條件下通常不會發(fā)生相互轉(zhuǎn)化。此外,T細胞還根據(jù)抗原經(jīng)歷被分為初始T細胞、近期激活或效應(yīng)T細胞以及記憶T細胞,這種分類具有清晰的概念邏輯。
20世紀90年代四色流式細胞術(shù)的出現(xiàn),使人們開始關(guān)注記憶T細胞的異質(zhì)性。中央記憶T (central memory T,TCM)細胞和效應(yīng)記憶T (effector memory T,TEM)細胞這兩個術(shù)語逐漸被廣泛接受,并且這些術(shù)語的分子和生物學(xué)定義也迅速發(fā)展 。TCM細胞和TEM細胞的命名與淋巴結(jié)歸巢受體(通常是人類的CC趨化因子受體7 (CCR7)和小鼠的L-選擇素(CD62L)) 的表達、人類CD45蛋白酪氨酸磷酸酶的亞型表達(CD45RO或CD45RA) 或非人靈長類動物Fas死亡受體(CD95) 和共刺激受體(CD28) 的表達模式相關(guān)。換句話說,同義亞群(也稱為“譜系”) 在每個物種中由不同的標記物定義,這些標記物被綜合起來解釋為與廣泛的生物學(xué)特性相關(guān)。更復(fù)雜的是,尤其是在人類中,還創(chuàng)造了一個常用術(shù)語TEMRA (T效應(yīng)記憶細胞重新表達CD45RA),用來描述那些CD8+“TEM細胞"中表達CD45RA+的細胞。實際上,TCM和TEM細胞亞群將遷移、功能、增殖和分化潛能等特性歸為一類,盡管一些研究人員更傾向于其中一種特性而不是另一種特性。
TCM/TEM范式與越來越多的證據(jù)表明CD4+T細胞具有功能特化相吻合,由此產(chǎn)生了T輔助細胞1 (TH1)、T輔助細胞2 (TH2)、調(diào)節(jié)性T細胞(Treg)、T輔助細胞9(TH9)、T輔助細胞17 (TH17)和濾泡輔助性T細胞 (T follicular helper cell,TFH)的分類,以及越來越多的亞群細分(例如,生發(fā)中心TFH(GC TFH)細胞與效應(yīng)TFH細胞,或多種類型的Treg細胞),但這些分類方法并未全面考慮T細胞群的遷移、增殖和分化潛能。記憶性T細胞存在于非淋巴組織中,它們一缺乏淋巴結(jié)歸巢分子的表達,二能快速執(zhí)行效應(yīng)功能,最初被納入TEM范疇。然而,由于大量證據(jù)表明這些細胞中的大多數(shù)不會在血液中循環(huán),因此它們隨后被重新命名為駐留記憶T細胞(resident memory T,TRM細胞),而不是被指定為TEM細胞的“子集”,以突出其遷移特性。
抗原的持續(xù)存在對T細胞分化有著深遠的影響。最初的T細胞命名法并未充分體現(xiàn)這一變量,因此“記憶”一詞過去(現(xiàn)在仍然)常被用來指代針對引起急性感染和慢性感染的病原體的特異性T細胞。然而,“耗竭”(以及幾個相關(guān)的術(shù)語)一詞被創(chuàng)造出來,用于描述在某些慢性感染和癌癥情況下占主導(dǎo)地位的功能低下T細胞。耗竭T細胞(Exhausted?T,TEX)亞群包含遷移性和駐留性T細胞,其中包括終末分化的T細胞、保留增殖和分化潛能的T細胞,以及介于兩者之間的T細胞。還有許多其他與分化潛能和壽命相關(guān)的T細胞亞群定義,例如干細胞記憶T細胞(TSCM)、記憶前體效應(yīng)細胞(MPEC)、短壽命效應(yīng)細胞(SLEC)和長壽命效應(yīng)細胞(LLEC)。
問題在于,隨著我們了解的深入,T細胞在遷移、功能、增殖和分化潛能等方面表現(xiàn)出多樣性,以及一些更難以衡量的特性,例如壽命及其影響特定免疫反應(yīng)(如病原體控制) 的能力。由于這些特性并非總是協(xié)同調(diào)控,因此有限的亞群詞匯本身就無法涵蓋所有相關(guān)的生物學(xué)特性。這導(dǎo)致了T細胞命名體系的臨時性擴展,這種擴展是自然而然發(fā)生的,缺乏自上而下的重組,而這種重組本應(yīng)受益于現(xiàn)有知識的綜合積累。
盡管該領(lǐng)域的專家可以應(yīng)對這種不完美的現(xiàn)狀,但這個問題可能很快就會變得更加糟糕。研究已經(jīng)遠遠超越了四色流式細胞術(shù)、細胞群的批量RNA測序或結(jié)果相對二元的檢測方法,這些方法都傾向于將細胞劃分為少數(shù)幾個亞群。近年來,許多高維單細胞技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)揭示并將繼續(xù)揭示T細胞的巨大異質(zhì)性。我們該如何利用這些信息?未來我們又該如何對T細胞進行分類,才能更有效地利用這些檢測方法,推動細胞免疫學(xué)邁入下一個描述性時代?目前將T細胞分類為包羅萬象且涇渭分明的亞群的策略,在什么情況下會變得不再可行?
在2020年于加拿大艾伯塔省班夫舉行的Keystone T細胞記憶會議伊始,約150名與會者參與了一項在線調(diào)查,詢問他們對常用術(shù)語的定義(調(diào)查結(jié)果凸顯了意見的多樣性)。隨后,會議舉辦了一場T細胞命名研討會,探討相關(guān)問題及潛在的解決方案。這場座無虛席的研討會由小組成員協(xié)調(diào)組織,但卻是一項非常具有社區(qū)性質(zhì)的活動,數(shù)十名參與者在麥克風(fēng)前發(fā)表意見,直到規(guī)定的時間結(jié)束。此次學(xué)術(shù)交流展現(xiàn)出一種共識,即T細胞免疫學(xué)領(lǐng)域的知識積累已經(jīng)超越了現(xiàn)有的命名體系。與會者在建設(shè)性的氛圍中討論并辯論了修訂方案的總體特征。
本文提出了兩個簡易方案和一個復(fù)雜方案(見方框1)。首先,作者應(yīng)在研究論文的方法部分,以單獨的標題清晰闡述相關(guān)子集的定義方式。雖然子集的定義方式可以有一定的靈活性,但所有研究論文都應(yīng)包含此項聲明,并由期刊編輯和審稿人強制執(zhí)行。其次,目前主要的子集定義過于模糊。有必要提供已發(fā)表的、包含具體定義和替代檢測方法的記錄。最后,應(yīng)開發(fā)一個能夠包容而非被高維分析所干擾的分類系統(tǒng)。該系統(tǒng)還應(yīng)能夠適應(yīng)新的發(fā)現(xiàn),同時兼顧不同研究領(lǐng)域、物種相關(guān)試劑或檢測方法的局限性以及各實驗室所采用的不同技術(shù)之間的技術(shù)差異。
這些指南旨在解決所有三個提出的解決方案。首先,要求作者在研究論文的方法部分定義子集術(shù)語使用的潛在實驗或證據(jù)基礎(chǔ)。編輯和審稿人也應(yīng)確保這一點。其次,提供現(xiàn)有術(shù)語的標準化定義,作為共同參考。最后,盡管我們很想就此止步,但我們希望著手解決更為棘手的問題,即提供一個用于重組T細胞命名法的模板。最終,我們提出了一種模塊化的命名方案,該方案能夠表示已知的生物學(xué)特性,而無需將各種特性捆綁到一個單一的、整齊的子集中(圖1)。

這種模塊化命名方案是一條可行之路。它既能與現(xiàn)有的命名實踐共存,又能適應(yīng)未來的發(fā)現(xiàn),同時避免出現(xiàn)大量新的亞群命名。該命名方案反映了T細胞異質(zhì)性的復(fù)雜性,因此失去了將記憶T細胞視為少數(shù)同質(zhì)“細胞類型”或亞群的概念和語言上的簡潔性。一些讀者甚至可能對這種策略感到不滿,因為他們意識到這代表了T細胞生物學(xué)表征方式的根本性范式轉(zhuǎn)變,因此可能會影響實驗的設(shè)計和結(jié)果解讀。如果這種命名方案沒有得到廣泛應(yīng)用或理解,無論其初衷多么美好,都將無法滿足我們當(dāng)前或未來的需求。時間會證明一切。然而,至少現(xiàn)在是時候重新思考我們?nèi)绾谓涣鱐細胞生物學(xué)了,而模塊化命名方案提供了一個起點。
作者應(yīng)在出版方法中定義術(shù)語
在方法部分,主要研究出版物必須明確總結(jié)研究中子集的定義方式(框2)。其目的并非制定子集定義的具體規(guī)則。研究和實驗?zāi)P涂赡艽嬖谝恍┚窒扌?,?dǎo)致結(jié)果不盡相同,但對亞群進行命名仍然有益。此項請求旨在提供更清晰、更透明的亞群命名依據(jù),以便于在論文中查找。例“TCM指的是CD62L+ CD44+ T細胞"或“TH17細胞的定義基于同源肽刺激后IL-17A胞內(nèi)染色和RORγt表達”。
現(xiàn)有子集命名法的定義,v1.0
在以下章節(jié)和表1-6中,我們提供了目前常用的一些T細胞亞群命名法的標準化定義。表中列出了替代標記物、檢測方法和物種特異性注意事項。需要注意的是,替代標記物和檢測方法與假定的生物學(xué)特性之間的相關(guān)性可能因具體情況而異。本列表標記為“v1.0”,表示未來可能會發(fā)布擴展和修訂版本,以反映T細胞免疫學(xué)領(lǐng)域不斷發(fā)展的知識和實踐。
主要TCRαβ+ T細胞分化狀態(tài)的定義

幼稚T細胞(Na?ve T cells)。幼稚T細胞是指已離開胸腺但尚未在胸腺外受到同源抗原刺激的未成熟T細胞,其表型仍保持未分化狀態(tài)。小鼠和人類最常用的幼稚T細胞標志物有所不同(表1)。在人類中,幼稚T細胞可定義為CCR7hiCD45RA+CD45RO-CD95- T細胞,這些細胞在短期(約5-12小時)TCR刺激后,干擾素-γ (IFNγ)、IL-4或IL-5的表達水平較低。在小鼠中,幼稚T細胞可定義為CD62L+ CD44low CD11alow CD122low T細胞,這些細胞在短期(約5-12小時)TCR刺激后,IFNγ、IL-4或IL-5的表達水平較低。
效應(yīng)T細胞(Effector T cell)。效應(yīng)T細胞表現(xiàn)出更高水平的“效應(yīng)”分子和基因表達,這些分子和基因是近期受刺激T細胞的特征(表1)。這一定義容易引起語義上的混淆,因為對一些研究者而言,“效應(yīng)”意味著終末分化和記憶潛能的喪失,而另一些研究者則不這么認為??乖?jīng)歷的T細胞在受到多種外源性刺激(包括TCR激活和/或旁觀者暴露于細胞因子)后,會短暫地獲得“效應(yīng)功能”(例如,表達抗菌或免疫刺激分子)。效應(yīng)功能的短暫表達(例如,靜息記憶T細胞暴露于型干擾素后)并不一定促進T細胞的進一步分化。因此,用“效應(yīng)”一詞來描述T細胞存在一些局限性。這些局限性包括:(1) 歷史上關(guān)于該詞是否意味著終末分化和短壽命的歧義;(2) 關(guān)于“效應(yīng)分子”或“效應(yīng)基因”的表達方式的歧義;以及 (3) 觀察到靜息記憶T細胞可以短暫表達效應(yīng)分子,而無需經(jīng)歷爆發(fā)式增殖(另見下文對“效應(yīng)記憶”T細胞的描述)。
活化T細胞(Activated T cell)?;罨疶細胞一詞常被用作效應(yīng)T細胞的同義詞,但含義更明確,不易產(chǎn)生歧義?!盎罨辈⒉话凳綯細胞的命運潛能、壽命或功能。它通常指近期T細胞受體(TCR)刺激,除非特別注明“旁觀者”活化。當(dāng)滿足以下兩個條件時:一、已知T細胞的抗原特異性(例如,通過MHC四聚體染色);二、已知抗原啟動或再刺激發(fā)生在數(shù)小時至數(shù)周前(例如,由于近期接種疫苗或感染),這些標準通常用于區(qū)分活化T細胞和記憶T細胞。在人類中,活化T細胞被定義為短暫表達CD69+、CD25hi和KLF2low。它們通常也被定義為Ki67+且表達效應(yīng)分子HLA-DR+和CD38hi。在小鼠中,活化T細胞短暫表達CD69+、CD25+和KLF2low。它們通常為Ki67+且效應(yīng)分子表達呈陽性(表1)。
記憶性T細胞(Memory T cell)?!坝洃洝币辉~既可以指免疫應(yīng)答的某個階段,也可以指一種細胞。當(dāng)提及免疫應(yīng)答的某個階段時,一些免疫學(xué)家會認為這意味著抗原已從機體中清除;而另一些免疫學(xué)家則認為這僅僅意味著自上次外源性抗原進入機體以來,已經(jīng)過去了相當(dāng)長的時間?!坝洃浖毎笔侵赣沙跏糡細胞激活和分化后增殖產(chǎn)生的子代細胞。記憶T細胞的典型特征是壽命長(數(shù)月至數(shù)十年) 和相對靜止。然而,記憶T細胞在功能潛能、定位、遷移特性、增殖潛能、發(fā)育可塑性、表觀遺傳特征、轉(zhuǎn)錄調(diào)控和表型等方面存在多樣性。關(guān)于T細胞何時才能被認定為記憶T細胞(而非活化T細胞) 的確切時間尚存爭議,但通常是在增殖爆發(fā)結(jié)束后的一段時間。從細胞表面標志物來看,很難將記憶性T細胞與各種類型的抗原經(jīng)歷T細胞區(qū)分開來。在人類中,記憶性T細胞表達CD11ahi,且通常表達CD95+、CD58+、CD49d+。在小鼠中,記憶性T細胞是CD44hi、CD11ahi,并且通常CD127+ (表1)。
無反應(yīng)性T細胞(Anergic T cell)。無反應(yīng)性T細胞是指先前已激活但持續(xù)處于低反應(yīng)狀態(tài)的T細胞,其特征是喪失了對TCR信號刺激產(chǎn)生IL-2的能力。當(dāng)無反應(yīng)性T細胞被轉(zhuǎn)移到淋巴細胞減少的宿主體內(nèi)時,會引發(fā)自身免疫,這表明它們具有自身反應(yīng)性TCR。幼稚TCR轉(zhuǎn)基因T細胞在暴露于同源抗原且無炎癥佐劑的情況下,會獲得無反應(yīng)性表型并喪失產(chǎn)生IL-2的能力。人類無反應(yīng)性T細胞的標志物尚未得到充分研究。在小鼠中,它們被定義為CD44+,F(xiàn)R4+,CD73+,F(xiàn)OXP3?,CD304 (也稱為NRP1)+和CXCR5? (表1)。
虛擬記憶T細胞(Virtual memory T cell)。虛擬記憶T (TVM) 細胞是幼稚T細胞,它們在未識別同源抗原的情況下增殖,導(dǎo)致部分分化并表達一些與抗原經(jīng)歷相關(guān)的標志物。若不進行小鼠的精確研究,很難對這些細胞進行明確定義。與小鼠中大多數(shù)經(jīng)歷過抗原的T細胞不同,TVM細胞保持CD49dlow表達。在小鼠中,它們的特征是CD44hi CD49dlow CD62Lhi CD122hi (表1)。
活化和效應(yīng)CD8+T細胞亞群

短壽命效應(yīng)細胞(Short-lived effector cells)。SLECs,也稱為終末效應(yīng) (terminal Effector,TE) 細胞,是高度分化的活化CD8+ T 細胞,具有細胞毒活性。這些 T 細胞在從活化狀態(tài)過渡到靜息狀態(tài)的過程中死亡。目前,SLECs 尚無明確的標志物,因為一些符合標志物標準的細胞能夠存活下來,完成向靜息狀態(tài)的過渡。然而,在人類中,SLECs 的特征是 CCR7?、CD45RA+、KLRG1+、TCF1low、T-bethi、CX3CR1+、CD127low、CD27? 和 CD57+;而在小鼠中,SLECs的特征是 KLRG1+ 和 CD127low(表 2)。
記憶前體效應(yīng)細胞(Memory precursor effector cells,MPEC)。MPECs,也稱為記憶前體細胞,是分化程度極低的活化CD8+T細胞,在從活化狀態(tài)向靜息狀態(tài)轉(zhuǎn)變的過程中具有很高的存活率。在人和小鼠中,MPECs會產(chǎn)生細胞因子,但其細胞毒性低于SLECs。,在小鼠中,MPECs為 CD127+,CD27+,KLRG1loW,TCF1+,T-betint,CD62L+/-,CX3CR1?和CXCR3+ (表2)。
早期效應(yīng)細胞(Early effector cells)。早期效應(yīng)細胞 (EECs) 是高度活化的CD8+ T 細胞,已多次分裂,產(chǎn)生 IFNγ 和腫瘤壞死因子 (TNF),但尚未分化為 SLECs 或獲得 MPECs 的特征。在人類和小鼠中,它們被鑒定為 KLRG1low、CD127?、CXCR3+、T-bet+、TCF1low CD8+ T細胞,能夠產(chǎn)生 IFNγ 和 TNF(表 2)。
長壽命效應(yīng)細胞(Long-lived effector cells)。LLECs 是記憶性 CD8+ T 細胞的一個亞群。這些細胞壽命長,具有高度細胞毒性,但在再次受到同源抗原刺激后增殖能力較弱。在人類和小鼠中,LLECs 的特征相似,均為 KLRG1hi、CD127int、CX3CR1hi 和顆粒酶 Bhi(表 2)。
CD4+?T細胞亞群

對于CD4+T細胞亞群,我們建議期刊在下標中使用輔助數(shù)字(例如,使用“H1"下標,而不是“H”下標或“TH1”無下標),以規(guī)范命名。
TH1細胞。TH1細胞是活化的或記憶性的CD4+ T細胞,它們傾向于表達IFNγ,但不表達IL-4、IL-5或IL-13。它們的發(fā)育依賴于轉(zhuǎn)錄因子T-bet。TH1細胞能夠增強機體對可逃避巨噬細胞胞內(nèi)殺傷的病原體的免疫力。在人類中,TH1細胞的特征是 CXCR3+、CCR4?、CCR6?、CXCR5? 和 T-bet+。它們在受到刺激時產(chǎn)生IFNγ。在小鼠中,TH1細胞的特征是T-bet+,并且在受到刺激時產(chǎn)生IFNγ(表3)。
TH2細胞。TH2細胞是活化的或記憶性的CD4+?T細胞,它們傾向于表達IL-4、IL-5和IL-13,但不表達IFNγ。它們的發(fā)育依賴于轉(zhuǎn)錄因子GATA3。TH2細胞促進對蠕蟲寄生蟲的免疫反應(yīng),并可引起過敏性炎癥。在人類中,它們被定義為CRTh2+、CXCR3?、CCR4+、CCR6?、CXCR5?和GATA3+,并且在受到刺激時表達IL-4+、IL-5+ 和/或IL-13+。小鼠TH2細胞被定義為GATA3+,并且在受到刺激時表達IL-4+、IL-5+和/或IL-13+(表3)。
TH9細胞。TH9 細胞是活化的或記憶性的CD4+?T細胞。它們易于表達IL-9。部分TH9 細胞群也表達 TH2 細胞相關(guān)的細胞因子,被稱為致病性 TH2 (pTH2) 細胞、人類的 TH2A(過敏性)細胞,或小鼠的 TH9RM(TH9 駐留記憶)細胞。它們的發(fā)育依賴于多種因素,包括轉(zhuǎn)錄因子PU.1、IRF4 和 BATF。在人類中,TH9 細胞 CXCR3?、CCR4+、CCR6?、CXCR5?、CCR8+ 和 PU.1+,并在活化時表達 IL-9。它們在皮膚中 PPARγ+。在小鼠中,TH9細胞PU.1+ 并在受到刺激時產(chǎn)生IL-9(表3)。
TH17細胞。TH17細胞是活化的或記憶性的CD4+?T細胞,它們易于分泌IL-17。它們的發(fā)育依賴于轉(zhuǎn)錄因子RORγt。TH17細胞參與屏障免疫,促進機體抵御胞外細菌和真菌的侵害。如果它們有助于維持屏障完整性,則可將其歸類為穩(wěn)態(tài)細胞;如果它們參與自身免疫或有害炎癥,則可將其歸類為致病細胞。在人類中,它們的特征是CXCR3?、CCR4+/?、CCR6+、CXCR5?和RORγt+,并且在受到刺激時表達IL-17。在小鼠中,它們表達RORγt和IL-17,并在受到刺激時表達(表3)。
CD4+?CTLs。CD4+ 細胞毒性T淋巴細胞(CD4+ cytotoxic T lymphocyte,CD4+ CTL)是一種具有細胞溶解活性的CD4+ T細胞。在人和小鼠中,CD4+ CTL均可通過體外鉻釋放試驗進行鑒定,其特征為顆粒酶B+、CCR7? 和CD27?。它們也可能表達CD95(也稱為FAS)(表3)。
TFH細胞。TFH細胞是CD4+ T細胞,能夠促進B細胞活化、分化、抗體產(chǎn)生、體細胞高頻突變、類別轉(zhuǎn)換和記憶。它們的發(fā)育依賴于BCL6。TFH細胞可與特定的細胞因子表達模式相關(guān),有時根據(jù)其分泌的細胞因子,以與輔助性T細胞亞群分類相對應(yīng)的方式進行命名(例如,TFH1或TFH2細胞)。在人和小鼠中,它們均為CXCR5+和BCL6+(表3)。
生發(fā)中心TFH細胞(GC TFH細胞)。生發(fā)中心TFH細胞是TFH細胞的一個亞群,位于淋巴器官的生發(fā)中心內(nèi),它們有助于選擇經(jīng)歷體細胞高頻突變的高親和力B細胞。在小鼠中,它們BCL6hi、CXCR5hi、PD-1hi、ICOS+、FR4hi且PSGL1low(表3)。
套區(qū)TFH細胞(MZ TFH細胞)。MZ TFH細胞(Mantle zone TFH),是位于B細胞濾泡套區(qū)內(nèi)的一類濾泡輔助性T細胞。它們可能是GC TFH細胞的前體細胞,也可能是GC TFH細胞從生發(fā)中心遷移回套區(qū)。在小鼠中,它們BCL6、CXCR5、PD-1和FR4表達較低,而PSGL1表達較高(表3)。
濾泡輔助性記憶T細胞(TFHM)。濾泡輔助性記憶T細胞(T follicular helper memory,TFHM)是長壽命的CD4+ TFH細胞,推測在抗原清除后仍然存在。在人類中,這些表達CXCR4+且FOXP3?;在小鼠中,它們TCF1+、FR4+、P2RX7+和CXCR4+(表3)。
調(diào)節(jié)性T細胞(Treg細胞),是CD4+ T細胞的一個亞群,負責(zé)調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)并促進免疫耐受。它們的發(fā)育依賴于轉(zhuǎn)錄因子FOXP3。在人和小鼠中,Treg細胞的常用標志物包括FOXP3+、CD25hi、CD127low、CTLA4hi和GITRhi(表3)。
胸腺來源的調(diào)節(jié)性T細胞(tTreg細胞),在胸腺發(fā)育過程中識別自身抗原后分化。它們也被稱為天然調(diào)節(jié)性T細胞。在人類中,僅憑標記物很難將tTreg細胞與外周來源的調(diào)節(jié)性T細胞(pTreg細胞)區(qū)分開來(見下文),但在小鼠中,tTreg細胞(而非pTreg細胞)通常表達神經(jīng)纖毛蛋白-1和helios(表3)。人類tTreg細胞的標記物為FOXP3+、CD25 hi、CCR7 hi、CD45RA+和CD45RO?。小鼠tTreg細胞的特征為FOXP3+、CD62L+、CD44 low、神經(jīng)纖毛蛋白-1 hi和helios hi。
外周來源的Treg細胞(pTreg細胞)。pTreg細胞在胸腺外發(fā)育,其發(fā)育過程中識別自身抗原(值得注意的是,這僅在將TCR轉(zhuǎn)基因T細胞轉(zhuǎn)移到攜帶模型抗原表達細胞(包括腫瘤細胞)的小鼠體內(nèi)的實驗中得到證實)或非自身抗原(例如,來自共生微生物群或膳食成分的抗原)。這些細胞也可稱為誘導(dǎo)型Treg細胞。在人類中,僅憑標記物很難將pTreg細胞與tTreg細胞區(qū)分開來,但小鼠的pTreg細胞通常對神經(jīng)纖毛蛋白-1和helios呈陰性。用于人類pTreg細胞的標記物包括:FOXP3+、CCR7hi、CD45RA+和CD45RO?;而用于小鼠pTreg細胞的標記物包括:FOXP3+、CD62L+、CD44 low、neuropilin-1 low、RORγt+或GATA3 hi,以及helios low/int。目前,尚無已建立的標記物用于區(qū)分人類tTreg細胞和pTreg細胞。
效應(yīng)調(diào)節(jié)性T細胞(eTreg)。效應(yīng)調(diào)節(jié)性T細胞(eTreg)是經(jīng)過進一步激活誘導(dǎo)分化的tTreg或pTreg細胞,這種分化改變了它們的遷移狀態(tài),并增強了它們分泌抑制性細胞因子(如IL-10和TGFβ)的能力。在人類中,eTreg細胞的標志物為FOXP3 hi、CD45RO+、CCR8 hi、ICOS hi和IRF4+。小鼠eTreg細胞的標志物為FOXP3 hi、CD62L?、CD44 hi、BLIMP1+、IL-10+和TGFβ+。
體外誘導(dǎo)的Treg細胞(iTreg)。體外誘導(dǎo)的Treg細胞是指在體外,在促進Treg細胞分化的細胞因子存在下,CD4+ T細胞分化為Treg細胞。
濾泡調(diào)節(jié)性T細胞(TFR細胞),是Treg細胞的一個亞群,定位于B細胞濾泡或生發(fā)中心(GC)內(nèi),它們可以調(diào)節(jié)自身反應(yīng)性和非靶向體液免疫應(yīng)答。人TFR細胞的標記物為CXCR5+、FOXP3+和GITR+。小鼠TFR細胞的標記物為CXCR5+、PD-1+、BCL6+、FOXP3+和GITR+。TFR細胞的定義基于其在B細胞濾泡中的定位。因此,表達FOXP3、CXCR5、BCL6和PD-1的CD4+ T細胞只有在有影像學(xué)數(shù)據(jù)支持的情況下才能被歸類為TFR細胞。
記憶T細胞亞群

以下亞群術(shù)語可用于指代CD4+或CD8+ T細胞群。對于CD4+ T細胞,這些術(shù)語通常與其功能特性無關(guān)(例如,TH1與TH2)。參見表4。
中央記憶T細胞(TCM細胞)。TCM細胞是記憶T細胞的一個亞群,它們在淋巴和血液之間循環(huán)。它們可以穿過靜息狀態(tài)下的高內(nèi)皮靜脈,通常在抗原刺激后表達IL-2,并且它們通常保持增殖和分化為效應(yīng)T細胞、TEM細胞和TRM細胞的能力。人TCM細胞的特征是CD62L+和CCR7+,其他標記物包括CD27+、CX3CR1?、CD45RO+和CD45RA?。小鼠TCM細胞的特征是CD44 hi和CD62L+,其他標記物包括CD122 hi、TCF1+、CCR7+、CD103?和CX3CR1?。
效應(yīng)記憶T細胞(TEM細胞)。TEM細胞是記憶性T細胞的一個亞群,缺乏關(guān)鍵的歸巢受體(即CD62L和CCR7),因此無法穿過淋巴結(jié)中大多數(shù)靜息的高內(nèi)皮靜脈。該術(shù)語描述了具有廣泛分化狀態(tài)和生物學(xué)特性的T細胞群。一些研究者將CD27+(TEM1)細胞與CD27?(TEM2)細胞區(qū)分開來。部分TEM細胞表達顆粒酶B和穿孔素,并具有快速細胞溶解活性。
重新表達CD45RA的效應(yīng)記憶T細胞(TEMRA細胞)。CD45RA+ T效應(yīng)記憶細胞(TEMRA細胞)是人類TEM細胞的一個亞群,表達CD45RA。該術(shù)語不適用于小鼠。它們的特征是CCR7?和CD45RA+。其他標記物包括CD27?、CX3CR1 hi和CD57+。TEMRA細胞通常具有快速細胞溶解活性,并表達顆粒酶B和穿孔素。
組織駐留記憶T細胞(TRM細胞)。TRM細胞是駐留在單個組織或器官內(nèi),不通過血液循環(huán)的記憶T細胞。目前用于識別這些細胞的替代標記物并不完美,因此可能需要使用檢測其遷移特性的檢測方法來鑒定它們。用于人類TRM細胞的標志物包括KLF2 low、CD69+、CD62L?和CCR7?。其他可能與TRM細胞相關(guān)的標志物包括P2RX7+(小鼠)、CD103+(尤其適用于CD8+ T細胞)、TCF1 low、CD49a+、CD101+和CXCR6+。然而,TRM細胞標志物會因器官、刺激史和環(huán)境擾動而異。用于鑒定TRM細胞的檢測方法包括:(1)器官移植;(2)評估轉(zhuǎn)入血液后的遷移情況;以及(3)比較不同器官中的TCR序列。在小鼠中,可以使用異體共生手術(shù)或光轉(zhuǎn)換實驗來鑒定TRM細胞。血管內(nèi)染色可以提供有關(guān)T細胞位置(血管內(nèi)或血管外)的信息,但無法提供有關(guān)T細胞遷移特性的信息。
終末循環(huán)記憶T細胞(ExTRM細胞)。終末循環(huán)記憶T細胞是指分化并重新進入循環(huán)系統(tǒng)的組織駐留記憶T細胞。它可能保留組織特異性駐留程序的表觀遺傳印記。在小鼠中,ExTRM在大多數(shù)標記物上與TEM細胞或TCM細胞表型相似。在小鼠中,這些細胞可能保留較高的CD43表達(可通過抗體克隆1B11檢測)。
外周記憶T細胞(TPM細胞)。外周記憶T細胞一詞用于描述在非淋巴組織和血液之間循環(huán)的記憶T細胞。目前,尚無明確的標志物可用于識別在非淋巴組織之間循環(huán)的T細胞。用于人類TPM細胞的標志物為CD45RA?、CCR7 int和CD27+。用于小鼠TPM細胞的標志物為CX3CR1 int、CCR7 int和CD27+。
干細胞記憶T細胞(TSCM細胞)。TSCM細胞是分化程度較低的記憶性T細胞亞群,相對稀少,但仍保留自我更新和分化為其他T細胞亞群的能力。TSCM細胞與初始T細胞有許多共同的標志物。人TSCM細胞的標志物包括CD95+、CCR7+、CD27+、CD28+、CD45RA+和Eomes?。小鼠TSCM細胞的標志物包括CD44 low、CD62L+、CD122+、CD27+、Sca-1+和CD127+。
與T細胞耗竭(TEX)相關(guān)的亞群

以下部分概述了TEX細胞的不同亞群。需要注意的是,TEX細胞亞群的標記物和區(qū)別會因具體情況而異(例如,癌癥與感染),尤其是在人類中。盡管如此,此處概述的基本原理在不同疾病和物種中似乎具有一致性。參見表5。
祖細胞或前體耗竭T細胞(TPEX細胞)。祖細胞或前體耗竭T細胞在慢性抗原刺激條件下維持T細胞應(yīng)答。TPEX細胞能夠響應(yīng)持續(xù)存在的抗原而自我更新,并分化為更具效應(yīng)樣功能的耗竭CD8+ T細胞和終末分化的耗竭CD8+ T細胞。TPEX細胞還介導(dǎo)PD-1免疫檢查點阻斷后的增殖爆發(fā)。與效應(yīng)T細胞和記憶T細胞相比,TPEX細胞維持著獨特的表觀遺傳圖譜,并且依賴于轉(zhuǎn)錄因子TOX。它們主要存在于二級和三級淋巴組織中。TPEX細胞也被稱為干細胞樣T細胞或干細胞樣PD-1+ T細胞。TPEX細胞常用的標記物有:PD-1+、TOX+、TCF1+、BCL6+、SLAMF6+、CXCR3+、LEF1+、CD28+、CD73+、XCL1+、CXCR5+(盡管該標記物常被膠原酶處理裂解)、TIM3?、CD39?、CX3CR1 lo/int和顆粒酶B?。
中間耗竭T細胞(TEX-int)和效應(yīng)樣耗竭T細胞(TEX-eff)。中間耗竭T細胞和效應(yīng)樣耗竭T細胞這兩個術(shù)語曾被用來描述過渡性TEX細胞。當(dāng)TPEX細胞在持續(xù)抗原或炎癥信號的刺激下增殖時,它們可能產(chǎn)生過渡性耗竭CD8+ T細胞,這些細胞表達效應(yīng)分子,例如顆粒酶B和穿孔素,并具有抗病毒和抗腫瘤功能。這些細胞離開淋巴組織,遷移到感染或腫瘤部位。PD-1靶向免疫療法可增強TEX-int細胞的生成。TEX-int細胞具有異質(zhì)性,其自然殺傷(NK)受體、干擾素刺激基因(ISG)、CXCR6和/或應(yīng)激相關(guān)基因的表達存在差異。用于 TEX-int 和 TEX-eff 細胞的標記物為:PD-1+、TOX+、TIM3+、T-bet+、顆粒酶 B+、穿孔素+、IFNγ+、CX3CR1+、TCF1?、SLAMF6?和 CD101?。
終末分化耗竭T細胞(TEX-term)。終末分化耗竭T細胞與TEX-int細胞相比,增殖能力低下,效應(yīng)功能降低且發(fā)生改變。TEX-term細胞仍保留有限的細胞毒性,產(chǎn)生少量效應(yīng)細胞因子,并表達有助于募集其他白細胞的趨化因子。TEX-term細胞可直接來源于TPEX細胞,也可來源于TEX-int細胞。在癌癥背景下,TEX-term細胞通常被稱為“功能異?!钡腡細胞。用于TEX-term細胞的標志物包括:PD-1+、TOX+、TIM3+、顆粒酶B+、CD39+、2B4+、CD101+、TCF-1?、SLAMF6?、CX3CR1?和CXCR3?。?
先天樣T細胞亞群

黏膜相關(guān)不變T(MAIT)細胞,是具有不變TCRα鏈和來自特定TCR庫的TCRβ鏈的T細胞(表 6)。MAIT細胞的TCR識別由非多態(tài)性MHC I類樣蛋白MR1呈遞的微生物核黃素衍生物抗原。在人類中,MAIT細胞被鑒定為CD3+和MR1-5OPRU tetramer+。在人血液中,CD3+、CD161+和Vα7.2+可能足以鑒定MAIT細胞。小鼠MAIT細胞被鑒定為CD3+、TCRβ+和MR1-5OPRU tetramer +。
不變型自然殺傷T(iNKT)細胞。不變型自然殺傷T細胞是自然殺傷T細胞的一個亞群,其T細胞受體(TCR)庫有限,并能在CD1d背景下識別自身和非自身脂質(zhì)抗原(表6)。在人體組織中,iNKT細胞被鑒定為CD3+和CD1d-αGalCe tetramer+。在人血液中,CD3+和Vα24J18(由抗體6B11檢測)+或Vα24+/Vβ11+足以鑒定iNKT細胞。小鼠iNKT細胞被鑒定為CD3+、TCRβ+和CD1d-αGalCer tetramer+。
γδ?T 細胞。一類淋巴細胞,其特征是表達TCRγδ抗原受體(表 6)。TCRγδ受體是重組的產(chǎn)物,其表達排除了TCRαβ的表達。在人類和小鼠中,部分γδ T細胞亞群存在于血液中,但許多亞群富集于非淋巴組織中。部分γδ T細胞亞群無需系統(tǒng)性啟動即可直接定植于組織中。與αβ T細胞不同,小鼠和人類中γδ T細胞的分布和功能與其TCRγ/Vδ的使用密切相關(guān),因此TCRγ/Vδ的使用是重要的標志物。在人血中,大多數(shù)γδ T細胞表達Vγ9Vδ2 TCR(可通過抗體克隆B6檢測)和CD161+、NKG2A+、CCR5+(活化后表達CD16+)。其他細胞被稱為Vδ2?,但主要表達Vδ1+,通常表達TIGIT+、CD31+、CD127+、CD62L+、CD49a?、CD101?和NKG2D+。幼稚Vδ2?細胞表達CD27+和CD45RA,而抗原刺激后的效應(yīng)細胞則表達γδ T CD27?、CD45RA+、CXCR3low和IL-7R?。在人類腸道中,大多數(shù)γδ T細胞為Vδ2?和Vδ1+,主要表達CD103、CD38、CD69、CD101、TIGIT、CD5?和CD18?。在這些腸道γδ T細胞中,Vγ4+細胞由丁酰乳蛋白樣蛋白3 (BTNL3)–BTNL8異二聚體特異性選擇,并以NKp46+和FcεR1γ+為標志;而表達Vγ2和Vγ3的細胞則為NKp46?、FcεR1γ?和CD31+。有研究提出,腸道Vδ1+細胞可根據(jù)效應(yīng)分子表達分為細胞毒性亞群和表達雙調(diào)蛋白(amphiregulin)的促進傷口修復(fù)的亞群。在人類皮膚中,γδ T 細胞大多為 Vδ1+、NKG2D+、CD69+、CXCR4+、CD44+ 和 CD28?。在小鼠脾臟和淋巴結(jié)中,γδ T細胞可根據(jù)其效應(yīng)潛能分為三大類。其中一類是γδIFNγ T細胞,主要產(chǎn)生IFNγ,其表達為CD27+、CD44+、CD45RB+、SCART1/SCART2? 和 CCR6?,且大多表達TCRVγ1+。另一類是γδ17 T細胞,主要產(chǎn)生IL-17A,其表達為CD44hi、CD27?、CD45RB?、SCART1/SCART2+和 CCR6+,且大多表達TCRVγ4+。還有一類是γδNKT細胞,其產(chǎn)生IL-4,表達為NK1.1+、PLZF+,且大多表達Vγ1Vδ6.3 或 Vγ1Vδ6.4。在小鼠表皮中,γδ T細胞主要為表達經(jīng)典Vγ5Vδ1 TCR的樹突狀表皮T細胞。這些細胞表達CD45RBhi、CD3 hi 和CD103 +。在小鼠真皮中,大多數(shù)γδ T細胞表達Vγ6Vδ1(部分細胞表達Vγ4+)。其他標志物包括CD44 +、CD69 + 、CD103 + 、CCR6+?和 CD27 ? 。在小鼠子宮中,大多數(shù)γδ T細胞表達Vγ6Vδ1(部分細胞表達Vγ4+)。這些細胞表達CD44+ 、CD69+、CD3 hi 、PD-1+ 、CD27? 、CD45RB? 、CD103+和CCR6+ 。最后,在小鼠腸道中,許多上皮內(nèi)淋巴細胞是γδ T細胞。這些細胞大多表達Vγ7,且為TIGIT+、CD69+、CD122+、LAG3+、Thy1?、CD8αα(約85%)、Fcεr1γ+、CD3hi CD5low和CD45RB+。
CD8αα+?TCRαβ T細胞。CD8αα+ TCRαβ T細胞是表達CD8αα同源二聚體而非更常見的CD8αβ異源二聚體的TCRαβ+ T細胞。CD8αα+ TCRαβ T細胞在黏膜表面大量存在,通常在周圍組織內(nèi)完成發(fā)育,并發(fā)揮效應(yīng)免疫和調(diào)節(jié)免疫功能。小鼠CD8αα+ TCRαβ T細胞除了CD8β?外,通常還表達胸腺白血病抗原四聚體。在人類中,大多數(shù)CD8αα+ TCRαβ T細胞為HLA-DR hi。
雙陰性(DN)T細胞。雙陰性T細胞缺乏傳統(tǒng)的共受體CD8αβ和CD4,但表達TCRαβ或TCRγδ。DN T細胞可能在胸腺或外周發(fā)育,并發(fā)揮效應(yīng)和調(diào)節(jié)功能。在小鼠中,DN T細胞為TCR+、CD3+、CD4?、CD8αβ?、NK1.1?。在人類中,DN T細胞為TCR+、CD3+、CD4?、CD8αβ?、CD56?。
胸腺外雙陽性(DP)T細胞。發(fā)育中的胸腺細胞在成熟過程中會短暫表達CD4和CD8。在胸腺外,雙陽性(DP)T細胞是一群異質(zhì)性細胞,它們同時表達傳統(tǒng)的T細胞共受體CD4和CD8(CD8αα或CD8αβ)。它們存在于健康個體中,但在自身免疫性疾病中更為常見。在小鼠和人類中,DP T細胞表達TCR、CD3、CD4和CD8(αα或αβ)。
模塊化命名法v1.0
模塊化方法的優(yōu)勢
模塊化命名法可以簡潔地概括T細胞生物學(xué)的復(fù)雜性,而無需創(chuàng)造大量亞群特異性標簽。舉例來說,英語僅由26個字母組成,卻發(fā)展出了近百萬個單詞的詞匯量,并且這個詞匯量還在不斷擴展和演變。盡管語言如此復(fù)雜,它仍然是一種高效的書面和口頭交流工具,而且易于學(xué)習(xí)。語言之所以能夠做到這一點,是因為它利用了模塊化的特性;字母組合形成特定的單詞,而單詞組合又可以構(gòu)成無限的思想和概念。
我們提出了一種簡單的模塊化策略來捕捉T細胞生物學(xué)的復(fù)雜性(圖1)。重要的是,該方案不會強迫研究人員推斷未測量的特性,能夠包容實驗的實際情況,并且涵蓋那些未(或無法)涉及特定生物學(xué)特性的研究。例如,研究人員常常被迫在給CD62L?和/或CCR7? T細胞分配TEM、TRM或TPM標簽(所有這些標簽都暗示了遷移特性)之間做出選擇,即使遷移特性未知。類比一下,如果只有一張球的黑白照片,就可以準確地描述該物體的許多方面,而無需判斷球是紅色還是藍色。免疫學(xué)也應(yīng)如此。模塊化命名法為研究人員提供了這種靈活性。作為起點,我們提出了一種可以適應(yīng)未來發(fā)現(xiàn)并不斷更新的語法。我們的目標是,未來的迭代將在此命名法的基礎(chǔ)上進行擴展,而無需推翻現(xiàn)有內(nèi)容。實用主義的考量凌駕于柏拉圖式的理想之上——結(jié)果,許多難以常規(guī)衡量的重要屬性被降格為外部形容詞,就像現(xiàn)在這樣。
這種模塊化命名法利用組合復(fù)雜性,分別指代不同的生物學(xué)特性。目前,它側(cè)重于功能、遷移和分化狀態(tài),并增加了簡潔地指明細胞是否存在于持續(xù)性抗原環(huán)境中,或者抗原是否已被生物體清除的能力(圖1)。這些特性已嵌入到現(xiàn)有的子集命名中,并且代表相對離散且易于測量(至少可以通過替代方法測量)的有形特征。該命名法并未全面涵蓋增殖潛能、分化潛能和壽命等重要特性。這些特性將像現(xiàn)在一樣,在簡潔的子集縮寫之外進行表達。然而,隨著我們測量或推斷這些特性的能力日趨成熟,包括轉(zhuǎn)錄因子分析和表觀遺傳譜分析,所提出的命名法可以擴展到包含新的術(shù)語。這既實現(xiàn)了特異性和適應(yīng)新發(fā)現(xiàn)的目標,又保持了合理的簡潔性(圖1)。還應(yīng)注意的是,這種命名法也可能適用于非T細胞群,例如NK細胞和固有淋巴細胞。鑒于“記憶”一詞越來越多地用于描述類似固有淋巴細胞的細胞,術(shù)語的統(tǒng)一或許正當(dāng)其時。
過渡到新的命名法
如果采用模塊化命名法,它可能會與現(xiàn)有的子集名稱共存一段時間(參見圖2中的命名法比較)。因此,我們避免了與現(xiàn)有縮寫重疊,以免造成混淆。特別是,我們避免使用“C”和“E”,以防止與TCM和TEM混淆,因為這兩個縮寫已經(jīng)衍生出多種含義。下文將介紹如何使用模塊化命名法來描述各種生物學(xué)特性。

譜系和功能
傳統(tǒng)T細胞可分為CD4+或CD8+,這應(yīng)該很簡單。非常規(guī)和先天樣T細胞群最初也會被命名為,例如γδ+、NKT、MAIT或CD8αα+(圖1)。T細胞的功能屬性將沿用目前的命名方式。這種命名方式對于CD4+T細胞尤為完善,擬議的命名法將與目前的實踐保持一致,用于指代CD4+ T細胞的TH1、TH2、TH9、TH17、TFH、Treg細胞及其相關(guān)亞類(例如,pTreg與tTreg細胞,后者與細胞發(fā)育有關(guān))。轉(zhuǎn)錄因子通常可作為這些亞類的代表。值得注意的是,由于CD4已有命名,因此使用“H”一詞(歷史上指“輔助”,但現(xiàn)在僅指CD4+)是多余的。然而,這種命名方式根深蒂固,且沒有明顯的缺陷,因此保留此慣例?!癈”一詞(歷史上指“細胞毒性cytotoxic”,但現(xiàn)在實際上指CD8+ T細胞)可用于在研究人員想要強調(diào)特定特性時指代CD8+T細胞。例如,CD8t Tc2 可用于描述分泌TH2樣細胞因子的CD8+ T細胞。CD8+ T細胞的其他功能性命名可能包括CD8+ Treg、Tc17 或 Tc22。可以將CD4+或CD8+細胞毒性T細胞統(tǒng)稱為TCTL,因為如上所述,c不再表示細胞毒性。
遷移屬性
已定義了幾種主要的遷移特性,因此,與現(xiàn)有做法相比,這些特性可能會導(dǎo)致最大的語法變化。遷移特性將分為兩大類:“S”和“D”(圖1和圖2)。S(代表次級淋巴器官(SLO))指能夠從血液進入未發(fā)炎的SLO的細胞。CD62L和/或CCR7的表達是合理的替代指標,與體外流式細胞術(shù)分析兼容,并且在大多數(shù)研究中可能已經(jīng)足夠。D(代表disseminated播散)指不傾向于從血液進入未發(fā)炎的SLO的細胞,CD62L和/或CCR7的缺失是合理的替代指標。值得注意的是,該術(shù)語廣泛涵蓋了目前所稱的TEM、TPM和TRM,但并未進一步具體說明遷移特性,而許多研究中尚未確定這些特性。如果研究者希望強調(diào)遷移特性未知和/或沒有評估歸巢受體,則會使用 U(未知)。
如果需要聲明細胞的駐留狀態(tài),則在D后添加下標R(resident駐留細胞)(即DR)。如果細胞取自靜脈血(預(yù)計會排除駐留細胞),且其他遷移特性未知,則在S、D或U后添加下標B(blood血液)(例如DB)。重要的是,盡管D標記排除了駐留狀態(tài),但它并未考慮非淋巴循環(huán),而這種循環(huán)很少被測量。如果需要聲明細胞在血液和非淋巴組織之間循環(huán),則在 S 或 D 后添加下標W(widespread廣泛分布)(例如DW)。這種包容性允許未知因素的存在,是模塊化命名策略的重要組成部分。它還可以適應(yīng)尚未發(fā)現(xiàn)的亞群或在當(dāng)前術(shù)語中很少提及的亞群,例如在非淋巴組織中循環(huán)的CD62L+和/或CCR7+ T細胞(稱為SW)。
分化狀態(tài)
分化狀態(tài)(如果已知)將按如下方式納入分類。使用字母“N”(naive幼稚型)、“A”(activated活化型)、“M”(memory記憶型)、“X”(exhausted耗竭型)和“G”(anergic無反應(yīng)型)來表示這些分化狀態(tài)?!癗”代表幼稚型T細胞,含義相對明確。但仔細思考后會發(fā)現(xiàn),活化型T細胞和記憶型T細胞之間的區(qū)別并非總是如此清晰,甚至同一細胞可能處于定義模糊、相互波動的狀態(tài)。然而,這些術(shù)語已被廣泛接受,人們普遍認為活化型T細胞近期通過抗原受體、細胞因子受體或其他激活受體受到外部刺激,而記憶型T細胞近期未受這些信號的干擾。人們也承認,在實踐中,這些界限常常模糊不清,針對慢性感染的T細胞通常被認為是記憶細胞的亞群。例如,人巨細胞病毒特異性CD8+ T細胞通常被稱為TEM或TEMRA(效應(yīng)記憶T細胞或CD45RA+效應(yīng)記憶T細胞)。事實上,TCM/TEM命名法并未明確區(qū)分近期激活的T細胞;所有接觸過抗原的T細胞都用M表示記憶。激活的T細胞可以用A表示。記憶細胞可以用M表示,這與現(xiàn)有的TCM、TEM和TRM命名法類似。耗竭的T細胞用X表示,無反應(yīng)性細胞用G表示。
分化狀態(tài)可進一步細分,使用下標“p”表示祖細胞,下標“t”表示終末細胞,這已成為耗竭T細胞的常用做法。因此,耗竭祖細胞(目前稱為TPEX)將被命名為Xp。具有高增殖和分化潛能的記憶T細胞(例如干細胞記憶T細胞,目前稱為TSCM細胞)將被命名為Mp。以前稱為記憶前體效應(yīng)細胞的活化T細胞將被命名為Ap,而短壽命的終末效應(yīng)細胞將被命名為At。
由于持續(xù)的抗原刺激對T細胞分化有重要影響,因此,添加一個簡潔的可選描述符來指示抗原清除或持續(xù)存在的情況可以提高描述的精確度。因此,當(dāng)合理認為抗原在生物體內(nèi)持續(xù)存在時,可以在細胞名稱后添加“+”(例如,M+)。當(dāng)合理認為同源抗原已從生物體內(nèi)清除,或者至少與所描述的細胞無關(guān)時,可以在分化狀態(tài)名稱后添加“0”(例如,記憶細胞可以稱為M0)。簡單的術(shù)語“M”將繼續(xù)廣泛使用,不再暗示抗原狀態(tài),就像現(xiàn)在一樣。
更簡潔、更精確,更易于未來調(diào)整
這種命名法的優(yōu)勢之一在于簡化了書面語言中的術(shù)語(參見表 7中的示例列表)。通過提供統(tǒng)一的語法規(guī)則,它無需再遵循期刊內(nèi)部差異很大的命名風(fēng)格(例如,Tcm、TCM、T cm或 T CM)。更重要的是,功能、遷移、分化狀態(tài)和抗原狀態(tài)的分離,使得術(shù)語能夠根據(jù)具體情況提供所需的特異性和精確度,而不會混淆不同的特性或?qū)е略~匯的無序泛濫。圖 3展示了如何用不同程度的細節(jié)來描述同一個細胞。換句話說,模塊化命名法不會強迫研究人員聲稱擁有未測量的特性。除了為科學(xué)家提供更多命名選擇之外,未來,模塊化命名系統(tǒng)還可以輕松擴展,納入更多生物學(xué)特性,以適應(yīng)該領(lǐng)域的發(fā)展和未來的發(fā)現(xiàn)(參見“結(jié)論”部分)。我們理解有些術(shù)語比傳統(tǒng)術(shù)語更難用語言表達,但這似乎是提高語言精確度所必須付出的合理代價。

結(jié)論
這些T細胞命名指南為常用術(shù)語提供了標準化定義,呼吁在研究報告中明確術(shù)語的使用,并提出了一種用于定義T細胞亞群的模塊化命名法。標準化定義有助于為該領(lǐng)域提供共享的術(shù)語表,并為亞群的命名提供共同的實驗依據(jù)。要求在研究報告的方法部分包含定義亞群的依據(jù),將有助于提高讀者和作者的透明度。雖然我們鼓勵期刊編輯積極支持這項建議,但我們的目的并非強制要求嚴格執(zhí)行亞群命名的黃金標準實驗要求,而是為了在不要求讀者仔細查閱每張圖(或補充圖)的情況下,實現(xiàn)更高的清晰度。
簡化的命名法在當(dāng)時具有變革性意義,但如今已難以容納大量涌現(xiàn)的重要新發(fā)現(xiàn)。模塊化命名法為解決命名多樣性問題提供了一個切實可行的方案,它不僅能夠適應(yīng)未來的發(fā)現(xiàn),還可以添加針對特定研究的額外描述符。它使作者擺脫了在有限數(shù)量的命名法中進行選擇的束縛,這些命名法雖然能夠提供對觀察結(jié)果概念化的“最佳匹配”,但并不完美。我們理解作者可以選擇使用模塊化命名法、現(xiàn)有命名法,甚至在同一篇論文中同時使用兩者,只要能夠?qū)崿F(xiàn)清晰明確的溝通即可。然而,無論以何種形式接受模塊化命名法,都將更好地滿足我們當(dāng)前和未來有效描述細胞免疫學(xué)復(fù)雜性的需求。
方法
為明確和改進T細胞命名法,一項共識性工作的決定是在2020年2月于加拿大艾伯塔省班夫舉行的Keystone T細胞記憶研討會上提出的。會議一致認為,所有研究人員在發(fā)表的原始論文中都必須清晰地解釋研究中T細胞亞群的定義。澄清現(xiàn)有T細胞命名法并制定替代命名法的工作于2020年至2025年間開展,主要由D.?Masopust和R. Ahmed領(lǐng)導(dǎo)。本文作為共識聲明,提出了關(guān)于現(xiàn)有T細胞命名法和替代模塊化T細胞命名法使用的最終建議。
Masopust, D., Awasthi, A., Bosselut, R.?et al.?Guidelines for T cell nomenclature.?Nat Rev Immunol?(2025). https://doi.org/10.1038/s41577-025-01238-2