企業(yè)績效考核和公共部門績效考核在形式、方法和標準等方面不同，但是其核心都是為了提高組織的效能，實現(xiàn)組織目標。二者差異表現(xiàn)在以下幾個方面：

1、價值取向不同

? ? ? 企業(yè)組織的績效目標是側(cè)重于投入產(chǎn)出比例，即企業(yè)強調(diào)自己組織的盈余率或利潤，在此基礎(chǔ)上才考慮組織的社會目標，基于此，企業(yè)要求員工關(guān)注與組織的利益。公共組織側(cè)重于加之層面的社會目標。即社會的公平與穩(wěn)定。公共組織的投入產(chǎn)出比例很難進行經(jīng)濟效益的衡量，公務(wù)人員的工作不關(guān)注組織的效益，而更多關(guān)注于社會價值和公眾的需求。由于公共組織和企業(yè)組織的追求價值不同，二者對員工的管理模式不同，因此政府公共組織更側(cè)重于考核的穩(wěn)定性、價值性、社會性，企業(yè)組織則更加注重效益和組織的競爭力。

2、目標不同

? ? ? 作為公共部門，其核心目標是為了實現(xiàn)公共利益，而企業(yè)則是為了實現(xiàn)自己的經(jīng)濟目標，即企業(yè)效益。二者的目標不同決定了二者的組織結(jié)構(gòu)、組織形式、運行機制不同。公共部門的設(shè)立運行有嚴格的組織程序和法律依據(jù)，每個部門的職能和職權(quán)都有法律嚴格規(guī)定，其運行具有相對的規(guī)范性和穩(wěn)定性，現(xiàn)代組織多是依據(jù)《組織法》和擁有法定職權(quán)，組織成員的選拔通過考錄方式進入。企業(yè)則是依據(jù)自身組織發(fā)展的需要，其組織成員按照產(chǎn)品的生產(chǎn)和銷售方式組成，具有較大的流動性。

3、員工的晉升、考核、獎懲方式不同

? ? ? 公共組織員工的晉升、獎懲多是依據(jù)比較呈溫和規(guī)范的公務(wù)員管理條例或法規(guī)來進行，獎懲側(cè)重于員工的德、能、勤、績等綜合性指標來進行，對員工的綜合考核涉及到員工的榮譽和社會地位，一般來說，公共組織不采取物質(zhì)獎勵的方式進行激勵員工，但是公共組織的考核往往是累加性的。即考核結(jié)果可以跨年度有效。企業(yè)組織以市場為唯一的目標，側(cè)重于經(jīng)濟獎懲，盡管現(xiàn)代企業(yè)采取了很多種運用考核激勵員工的方法，但是在激烈的市場競爭和人才高速流動背景下，企業(yè)員工晉升、獎懲具有跨越式的特點。