單細(xì)胞SRR數(shù)據(jù)拆分

10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fastq

fastq-dump SRA轉(zhuǎn)fastq

#10x SRR需要加--split-file和--include-technical參數(shù)
fasterq-dump -O ./ --split-files -e 40 ./SRR7722937  --include-technical
ls -lh

參考鏈接：
10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fastq踩坑那些事
fasterq快速轉(zhuǎn)換sra文件到fastq測(cè)序數(shù)據(jù)
單細(xì)胞實(shí)戰(zhàn)(二) cell ranger使用前注意事項(xiàng)

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