發(fā)簡信
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UMAP/TSNE 突出顯示一個細(xì)胞群的顏色突出顯示一個細(xì)胞群的顏色
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R繪制棒棒圖和通路展示R繪制棒棒圖并且合并富集的結(jié)果 圖像可視化 分析文件如下： 繪制代碼如下：
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sessionInfo() 重定向輸出到文件
sessionInfo() 重定向輸出到文件 文件 session_info.txt 就會包含： R 版本 平臺信息 已加載的包及其版本號
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DimPlot散點圖解決顏色疊加問題問題： 有時候拿到的樣本的UMAP圖形如下：灰色的細(xì)胞點多于紫色的細(xì)胞點，顯示的結(jié)果都是都一個樣本的細(xì)胞 針對以上問題DimPlot有個參數(shù)：s...
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單細(xì)胞細(xì)胞定義單細(xì)胞細(xì)胞定義合集 對于單細(xì)胞數(shù)據(jù)細(xì)胞分群的定義，一直是困惑大家的工作。對一直從事單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的工作人員，細(xì)胞定義非常簡單；但是新手小白來說還...
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利用ggplot2繪制SCI樣式的UMAP圖Seurat包展示出來的umap/tsne圖都是帶有橫縱坐標(biāo)，基于Seurat包可能比較難調(diào)整圖片的樣式，只能借助AI或者PS處理圖片。這次借助...
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單細(xì)胞SRR數(shù)據(jù)拆分
10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fastq fastq-dump SRA轉(zhuǎn)fastq 參考鏈接：10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fa...
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ggplot2 金字塔圖形（雙向柱狀圖）這篇文章主要是分享一下金字塔圖形的繪制方法，其來源是文章中的圖E，如下： 看了一下，可以通過ggplot2來實現(xiàn)，數(shù)據(jù)來自于自己試驗的數(shù)據(jù)（該數(shù)...
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Shell腳本循環(huán)讀取文件內(nèi)容,文件列表和配置文件
1、使用for循環(huán) -文件內(nèi)容 or 2、使用for循環(huán) -文件名稱 or 3.使用while循環(huán) -文件名稱 4.使用source循環(huán) 讀取配...