突出顯示一個細胞群的顏色
發(fā)簡信
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sessionInfo() 重定向輸出到文件
sessionInfo() 重定向輸出到文件 文件 session_info.txt 就會包含： R 版本 平臺信息 已加載的包及其版本號
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DimPlot散點圖解決顏色疊加問題問題： 有時候拿到的樣本的UMAP圖形如下：灰色的細胞點多于紫色的細胞點，顯示的結果都是都一個樣本的細胞 針對以上問題DimPlot有個參數(shù)：shuffle可以解決這個問題 ...
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test_meta.txt test_counts.txt 這兩個文件可以指定全路徑
CellPhoneDB
背景介紹 CellPhoneDB是公開提供的精選受體，配體及其相互作用的存儲庫。配體和受體均包含亞基結構，可準確代表異聚復合物。這是至關重要的，因為細胞之間的通信依賴于多亞基...
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一個R包玩轉單細胞免疫組庫分析，還能與Seurat無縫對接
在介紹clonotypr(https://github.com/mattfemia/clonotypr)包之前，我們需要先去解決幾個問題： （1）為什么要進行單細胞免疫組庫的...
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利用ggplot2繪制SCI樣式的UMAP圖Seurat包展示出來的umap/tsne圖都是帶有橫縱坐標，基于Seurat包可能比較難調整圖片的樣式，只能借助AI或者PS處理圖片。這次借助ggplot2進行可視化，對于...
