學(xué)習(xí)小組Day-3筆記--丁覽博

day3 思維導(dǎo)圖.png

圖片來(lái)自pad os端mindnode

Linux環(huán)境下軟件安裝

1.認(rèn)識(shí)conda

Linux系統(tǒng)下的軟件包管理器，類(lèi)比于iPhone的app store

2.在服務(wù)器下載miniconda

到達(dá)生信軟件目錄下:cd biosoft
下載軟件:wget *清華鏡像網(wǎng)站復(fù)制的鏈接*

3.安裝配置miniconda

3-1安裝：bash M+tab鍵
3-2激活conda:source ~/.bashrc
3-3添加鏡像: copy code and press enter

4.使用miniconda

4-1查看所有軟件列表:conda list
4-2搜索軟件:conda search software
4-3安裝軟件

  • 自動(dòng)安裝:conda install software -y
  • 指定版本:conda install software=6.6.2 -

4-4卸載軟件:conda remove software -y

5.定制conda環(huán)境

5-1 查看當(dāng)前環(huán)境:conda info --envs
5-2創(chuàng)建指定python版本并安裝軟件的conda環(huán)境
conda create -n rnaseq python=3 fastqc trimmomatic -y
5-3激活新的環(huán)境:conda activate rnaseq

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