rMATS是常用的選擇性剪切(alternative splicing)分析軟件。目前最新版是rMATS 4.1.2,已經(jīng)可以通過conda安裝,步驟如下:
第一步創(chuàng)建小環(huán)境rmats
conda create -n rmats -y
conda activate rmats
第二步,安裝rMATS 4.1.2
conda install -c bioconda rmats
第三步進(jìn)入到rMATS軟件目錄
cd ~/miniconda3/envs/rmats/rMATS
第四步測試rMATS
python rmats.py -h

image.png
第五步,查看版本
python rmats.py --version

image.png
至此,安裝成功,下一步進(jìn)行軟件測試。