選擇性剪切分析軟件rMATS 4.1.2安裝

rMATS是常用的選擇性剪切(alternative splicing)分析軟件。目前最新版是rMATS 4.1.2,已經(jīng)可以通過conda安裝,步驟如下:
第一步創(chuàng)建小環(huán)境rmats

conda create -n rmats -y
conda activate rmats

第二步,安裝rMATS 4.1.2

conda install -c bioconda rmats

第三步進(jìn)入到rMATS軟件目錄

cd ~/miniconda3/envs/rmats/rMATS

第四步測試rMATS

python rmats.py -h
image.png

第五步,查看版本

python rmats.py --version
image.png

至此,安裝成功,下一步進(jìn)行軟件測試。

參考:詳細(xì)介紹最新版可變剪接軟件rMATS

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時請結(jié)合常識與多方信息審慎甄別。
平臺聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發(fā)布平臺,僅提供信息存儲服務(wù)。

友情鏈接更多精彩內(nèi)容