在新型冠狀病毒的治療方案中，通過同源建模方法發(fā)布了新冠病毒的三維結(jié)構(gòu)，通過藥物靶標(biāo)預(yù)測、篩選出針對新型冠狀病毒的藥物，通過一系列計算機(jī)輔助藥物生物計算的方法發(fā)現(xiàn)一大類藥物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染，為治療新冠提供了新機(jī)理和新思路。
生物分子互作基礎(chǔ)
課程內(nèi)容：
1.生物分子互作用研究方法
1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理
1.2 分子對接研究生物分子相互作用
1.3 蛋白蛋白對接研究分子相互作用
蛋白數(shù)據(jù)庫
課程內(nèi)容：
1. PDB 數(shù)據(jù)庫介紹
1.1 PDB蛋白數(shù)據(jù)庫功能
1.2 PDB蛋白數(shù)據(jù)可獲取資源
1.3 PDB蛋白數(shù)據(jù)庫對藥物研發(fā)的重要性
2.PDB 數(shù)據(jù)庫的使用
2.1 靶點(diǎn)蛋白結(jié)構(gòu)類型、數(shù)據(jù)解讀及下載
2.2 靶點(diǎn)蛋白結(jié)構(gòu)序列下載
2.3 靶點(diǎn)蛋白背景分析及相關(guān)數(shù)據(jù)資源獲取途徑
2.4 批量下載蛋白晶體結(jié)構(gòu)
蛋白結(jié)構(gòu)分析
課程內(nèi)容：
1. Pymol 軟件介紹
1.1 軟件安裝及初始設(shè)置
1.2 基本知識介紹（如氫鍵等）
2.Pymol 軟件使用
2.1蛋白小分子相互作用圖解
2.2 蛋白蛋白相互作用圖解
2.3 蛋白及小分子表面圖、靜電勢表示
2.4蛋白及小分子結(jié)構(gòu)疊加及比對
2.5繪相互作用力
2.6 Pymol動畫制作
3.實(shí)例講解與練習(xí)：
（1）尼洛替尼與靶點(diǎn)的相互作用，列出相互作用的氨基酸，并導(dǎo)出結(jié)合模式圖
（2）制作結(jié)合口袋表面圖
（3）Bcr/Abl靶點(diǎn)的PDB結(jié)構(gòu)疊合
（4）制作蛋白相互作用動畫
（5）針對ACE2和新冠病毒Spike的蛋白晶體復(fù)合物，制作蛋白-蛋白相互作用圖
