前言：寫這篇文章的目的是為了梳理一下學(xué)習(xí)思路，按部就班地仿生信菜鳥(niǎo)團(tuán)和簡(jiǎn)書：Y大寬教程大綱，做歸納整理，即便再次運(yùn)行，仍然遇到代碼出錯(cuò)或者軟件使...
投稿
收錄了39篇文章 · 112人關(guān)注
-
RNA-seq實(shí)戰(zhàn) -
轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開(kāi), https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
-
轉(zhuǎn)錄組全新學(xué)習(xí)之總篇
Y叔的RNA-seq workflow 強(qiáng)力推薦[https://github.com/twbattaglia/RNAseq-workflow]...
-
[前期]無(wú)參轉(zhuǎn)錄組知識(shí)儲(chǔ)備
劉小澤寫于19.1.25最近要開(kāi)始一批無(wú)參轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)，我喜歡在學(xué)東西時(shí)先學(xué)一些知識(shí)儲(chǔ)備，現(xiàn)在不太喜歡拿來(lái)代碼直接去跑，可能對(duì)背后的原理性東西想要...
-
無(wú)參轉(zhuǎn)錄組起步劉小澤寫于19.2.1??發(fā)覺(jué)好久沒(méi)寫了，果然臨近過(guò)年事情比較多，最近重新開(kāi)始無(wú)參轉(zhuǎn)錄組。這次先從數(shù)據(jù)下載做到得到組裝的轉(zhuǎn)錄本 數(shù)據(jù)來(lái)源 Defi...
-
一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（四）featureCounts
好久沒(méi)更新啦，因?yàn)樽罱鼪](méi)有在跑項(xiàng)目哦，所以就擱置了，最近要做一兩張圖，所以把前面寫的教程先發(fā)布一下~ 前期文章 一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--...
-
一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（三）Alignment 比對(duì)前期文章 一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（一）一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（二）QC 3 ...
-
一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（二）QC前期文章 一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（一） Q1: 在上一期中，有人問(wèn)到：為什么不能用toplevel的參考基因組...
-
一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq（一）
由于實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有服務(wù)器，我只有一臺(tái)iMac，跟之前學(xué)的時(shí)候已經(jīng)有完善的服務(wù)器系統(tǒng)完全不一樣，我需要在iMac上搭建環(huán)境用于分析數(shù)據(jù)。 0. 準(zhǔn)備工...
-
1.轉(zhuǎn)錄組 | 上游分析（數(shù)據(jù)下載，比對(duì)，計(jì)數(shù)）參考：轉(zhuǎn)錄組分析記錄； 轉(zhuǎn)錄組入門和進(jìn)階以下內(nèi)容為轉(zhuǎn)錄組全部的上游分析，包括下載數(shù)據(jù)、比對(duì)、計(jì)數(shù)得到表達(dá)矩陣。https://www.ncbi....
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1711309/crop1547951426366.jpg', '推薦專題《轉(zhuǎn)錄組分析》（ 分享自 @簡(jiǎn)書 ）','http://www.itdecent.cn/c/866c4a1e5abb?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁(yè)面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}