BSA定位單基因性狀

在前面,我們詳細(xì)介紹了經(jīng)過粗定位篩選后,如何進(jìn)行精細(xì)定位的詳細(xì)步驟。其實(shí)在許多情況下,對基因進(jìn)行定位是不需要進(jìn)行精細(xì)定位的。一般由單基因控制的質(zhì)量性狀以及EMS誘變的基因定位都是不需要進(jìn)行精細(xì)定位,直接采用BSA的方法就能定位到基因。

(Takagi et al., 2013)

? ? ? ? BSA(Bulk segregation analysis)又稱混池分析法,這一方法一般用于由多個基因調(diào)控的數(shù)量性狀的初步定位。數(shù)量性狀在表型上呈現(xiàn)連續(xù)分布,極端表型在群體中所占的比例很小。因此選取兩端的極端值進(jìn)行混樣建庫測序能夠把與目標(biāo)性狀相關(guān)聯(lián)的SNP找出來。

? ? ? ? 對于質(zhì)量性狀,在性狀上的表型上是不連續(xù)分布的,只有兩種表型狀態(tài)。傳統(tǒng)的圖位克隆的方法雖然能夠找出與數(shù)量性狀相關(guān)的基因/區(qū)域。但是這種方法費(fèi)時費(fèi)力。而BSA則能夠?qū)⒁罁?jù)表型選擇建立兩個庫,最終能夠定到單基因。

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