2020-02-01

刺突蛋白(SPIKE)阻滯劑,一路做3CLPro蛋白酶的抑制劑小分子。

倫地西韋,3CLpro-1和一種新型乙烯砜蛋白酶抑制劑。


我們當(dāng)時(shí)是做 RNA和蛋白序列上的分析比較。

首先,比較得出新型冠狀病毒跟SARS病毒是最高度同源。然后,我們選擇了Spike(刺突蛋白), RdRp(RNA復(fù)制酶), 3CLpro和 PLpro四種蛋白做為靶點(diǎn),去分析它們?cè)趦煞N病毒中的相似性,以及對(duì)活性中心的影響,做更深入的比較。

最終得出,兩種病毒的刺突蛋白沒有什么同源性,特別是結(jié)合點(diǎn),所以尋找刺突蛋白阻滯劑的路并不通。但好在,我們也同時(shí)發(fā)現(xiàn),RNA復(fù)制酶和兩個(gè)主要蛋白酶3CLpro和 PLpro不僅高序列相似性,模擬結(jié)構(gòu)相似性也高度一致,為生物制劑和環(huán)狀多肽類藥物提供了潛在靶點(diǎn)。而序列和結(jié)構(gòu)的高度一致性,也表明針對(duì)SARS這些酶的小分子藥物,基本不需要任何顧慮,就可以用在新型冠狀病毒的治療上。

新型冠狀病毒上刺突蛋白的變異意味著什么?

在調(diào)研的過程中,我們將新型冠狀病毒與SARS病毒做了比較。針對(duì)刺突蛋白這一塊,當(dāng)時(shí)比較結(jié)果出來時(shí),我們是非常震驚的。因?yàn)樾滦凸跔畈《旧系拇掏坏鞍變?nèi)在結(jié)合人的受體的部分出現(xiàn)了大量非保守性突變。這意味著,現(xiàn)在已有的針對(duì)SARS這一塊的藥物,對(duì)新型冠狀病毒基本可以判定沒有用。

事實(shí)上,在我們研究結(jié)果出來之前,中國國內(nèi)已經(jīng)有幾篇文章顯示相關(guān)人員在實(shí)驗(yàn)室做了簡(jiǎn)單的比對(duì),但他們并沒有留意到一些重要氨基酸的突變。因此,對(duì)于目前人們預(yù)測(cè)新型冠狀病毒的受體結(jié)合區(qū)域與ACE2受體的相互作用將弱于SARS冠狀病毒這一觀點(diǎn),我是持懷疑態(tài)度的。

倫地西韋是對(duì)RNA復(fù)制酶有抑制作用,并且表現(xiàn)極佳。而像其他的主要蛋白酶,則是因?yàn)楝F(xiàn)在研究還不夠,沒有特別好的小分子藥物可以抑制。

其次是倫地西韋經(jīng)過了第Ⅰ、Ⅱ期臨床實(shí)驗(yàn),其中就有針對(duì)毒理性的試驗(yàn)。目前,該藥已經(jīng)被用到感染MERS病毒的患者身上。現(xiàn)在看,它對(duì)人體并沒帶來太大的傷害性。

但如果說沒有副作用也是不負(fù)責(zé)任的。因?yàn)樵撍幨且种芌NA合成的一個(gè)小分子,所以對(duì)人體是肯定有影響的,具體得看藥理毒理評(píng)價(jià)。


核酸鏈間腺嘌呤和尿嘧啶(RNA)或胸腺嘧啶(DNA)以及鳥嘌呤和胞嘧啶的專一氫鏈結(jié)合。分子雜交技術(shù)就是根據(jù)堿基配對(duì)的原理設(shè)計(jì)的。堿基配對(duì)后形成堿基對(duì)(basepair,bp),常用作DNA分子的量度,如人類的線粒體DNA為16569bp。配對(duì)的堿基互稱互補(bǔ)堿基(complementary base),若一條核酸鏈的堿基序列與另一條核酸鏈的堿基序列反平行配對(duì),則二者互稱互補(bǔ)鏈(complementary strand),如與RNA互補(bǔ)的DNA稱互補(bǔ)DNA(cDNA)

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