2022-06-17 單細胞數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換

  • Seurat 格式轉(zhuǎn)換成SingleCellExperiment
    library(sceasy)
    sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="sce", outFile='filename.rds')
  • Seurat 轉(zhuǎn)換成 AnnData
    sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="anndata", outFile='filename.h5ad')
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