發(fā)簡(jiǎn)信
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在做monocle3的最后需要在圖中顯示軌跡，會(huì)用到plot_cells這個(gè)函數(shù)，如 plot_cells(cds, label_groups_...
從文章中下載的數(shù)據(jù)往往是一個(gè)表達(dá)矩陣和metadata.txt，如何使用這兩個(gè)數(shù)據(jù)呢？ 讀入表達(dá)矩陣，創(chuàng)建seurat對(duì)象nature<-rea...
1.在Python上用scanpy分析單細(xì)胞的時(shí)候，做到sc.pp.calculate_qc_metrics(adata, qc_vars=['...
在seurat分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)的時(shí)候，用了PercentageFeatureSet這個(gè)函數(shù)，報(bào)錯(cuò)了： Error in h(simpleError...
從文章里下的RNA-seq的數(shù)據(jù)分析，在做到sam轉(zhuǎn)bam這一步時(shí)候報(bào)錯(cuò)，我先用的代碼是samtools sort -O BAM -o d2_r...
服務(wù)器版本：Centos7.8 1.root權(quán)限創(chuàng)建一個(gè)叫shiny的用戶useradd shinypasswd shiny2.賦予shiny用...
解決方法conda install -c conda-forge imagemagick再重新運(yùn)行install.packages("ggima...
這篇文章主要介紹做RNA Velocity需要怎么做，至于原理請(qǐng)參考原文章 在做RNA速率之前需要先準(zhǔn)備loom文件，換句話說(shuō)就是要完成RNA速...
Seurat 格式轉(zhuǎn)換成SingleCellExperimentlibrary(sceasy)sceasy::convertFormat(seu...