整合之后，是否還需標(biāo)準(zhǔn)化、縮放數(shù)據(jù)呢？我看到整合之前已經(jīng)對每個樣本進行處理了
Seurat包其中的FindIntegrationAnchors函數(shù)解析在用Seurat包做多樣本整合的時候，我們通常采用兩種方式：（1）merge的方式（2）FindIntegrationAnchors的方式整合這里我們來解析一下FindInt...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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females這個變量是怎么來的呢？
(Smartseq2) single cell RNA-seq分析練習(xí)
這次跟著課程（Smartseq2 scRNA小鼠發(fā)育學(xué)習(xí)筆記-1-前言及上游介紹）要練習(xí)的文章是：Dissecting Cell Lineage Specification ...
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因為該文件中有些行不存這個這段，所以提示的警告信息，可忽略
「簡化基因組」如何過濾用GATK分析得到的SNP
GATK官方提供了一個SNP過濾的標(biāo)準(zhǔn)，howto-apply-hard-filters-to-a-call-set,如果你按照它的要求來過濾簡化基因組中的SNP數(shù)據(jù)，也就是...
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請問下，在“輸出結(jié)果”中，A、B兩列也是細(xì)菌對分類的貢獻(xiàn)度嗎？
16S測序分析（五）用RandomForest尋找關(guān)鍵細(xì)菌
導(dǎo)讀 用隨機森林“分類”的方法尋找16S測序數(shù)據(jù)中與分組有關(guān)的細(xì)菌。 一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 標(biāo)準(zhǔn)化細(xì)菌豐度表格式要求：不用放樣本ID；最后一列放分組變量 二、R分析準(zhǔn)備 三、隨機森林...
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作業(yè)在：RNA-seq小考核 | 生信菜鳥團，鏈接是 http://www.bio-info-trainee.com/3920.html 任務(wù)量有點重，歡迎大家在提交作業(yè)的同時寫一下自己的心得體會，踩坑記錄等等
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歡迎大家分享自己在完成生信技能樹linux作業(yè)時的筆記心得 。 生信人的 linux 20題 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html 處理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式（約定成俗，大牛推廣）**的數(shù)據(jù) fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3575.html sam和bam格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3578.html VCF格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
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請問，文中所用的三個測序數(shù)據(jù)的SRR號分別是什么呢？
WES(全外顯子)分析(上)
感悟： 軟件不看幫助文檔，不閱讀說明書，就只能抄代碼，卻不知道錯在哪里。不想要成為代碼搬運工。 1. 分析前工作準(zhǔn)備 1.1 創(chuàng)建環(huán)境： 1.2 需要軟件： ascp,sam...
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植物：<br>細(xì)胞遺傳<br>系統(tǒng)進化<br>wudandan90@163.com
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生信技能樹，生信菜鳥團，jimmy
