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IP屬地:福建
  • @To_2020_1_4 你好,用fastq的時候遇上一個問題,前兩天做單端和雙端測序的質(zhì)控時都沒有遇上問題,都能得到質(zhì)控的結(jié)果,但是今天又回來一批數(shù)據(jù)要質(zhì)控,但是一直報錯,提醒找不到的這些文件其實都有在,統(tǒng)一用集群跑得時候一直報錯,但是單挑拿出來跑又不會,很苦惱
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    ERROR: file 'fastq/SES-MC-rep1_1.fq.gz' doesn't exist, quit now
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    Error to read gzip file
    ERROR: file 'fastq/SES-BSC-rep1_1.fq.gz' doesn't exist, quit now
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    ERROR: file 'fastq/SES-SC-rep1_1.fq.gz' doesn't exist, quit now

    使用fastp進行數(shù)據(jù)質(zhì)控

    fastp是一款較新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件,接觸這個軟件也是由于目前市場的軟件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接觸到一個RNAseq數(shù)據(jù),質(zhì)量較差,需要去除接頭而且含N較多,序列...

  • @To_2020_1_4 好的,非常感謝!

    使用fastp進行數(shù)據(jù)質(zhì)控

    fastp是一款較新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件,接觸這個軟件也是由于目前市場的軟件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接觸到一個RNAseq數(shù)據(jù),質(zhì)量較差,需要去除接頭而且含N較多,序列...

  • 你好,請教個問題,我的同一個植株取了不同的組織進行測序后回來的數(shù)據(jù)用fastq進行質(zhì)控,是需要每一個樣本出一個fastq.html,還是全部的組織出一個fastq.html的文件
    謝謝

    使用fastp進行數(shù)據(jù)質(zhì)控

    fastp是一款較新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件,接觸這個軟件也是由于目前市場的軟件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接觸到一個RNAseq數(shù)據(jù),質(zhì)量較差,需要去除接頭而且含N較多,序列...

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