發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：寧夏
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關(guān)于macs2
1. macs2 bdgcmp的用法 macs2 bdgcmp是用來比較和處理兩個(gè)由MACS2生成的bedGraph文件的。它的主要用途是從兩個(gè)...
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Resolve Error when install monocle3
https://stackoverflow.com/questions/48547046/resetting-conda-channel-pri...
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bcl2fastq、mkfastq和base2fastq
bcl2fastq和mkfastq是用于將Illumina測(cè)序平臺(tái)生成的原始BCL（Base Call）文件轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)FASTQ文件格式的工具。...
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Scrublet
其大致思想是通過判斷每一個(gè)元素與中位值的偏差是否處于合理的范圍內(nèi)來判斷該元素是否為離群值。(對(duì)于離群值 1 調(diào)整 2 剔除)在這里我沒有調(diào)整離群...
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基于Seurat v3 object 從頭構(gòu)建 monocle的 CDS
文章轉(zhuǎn)自作者：阿糖胞苷鏈接：http://www.itdecent.cn/p/41372e039194來源：簡(jiǎn)書簡(jiǎn)書著作權(quán)歸作者所有，任何形式...
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doublet 和 multiplet在單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）中，multiplets和doublets是兩種不同的細(xì)胞組合情況。 Multiplets（多細(xì)胞聚集）...
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Reconstruction of development landscape based on scRNA-seq
There are several basic questions of developmental biology : What classe...
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清除單細(xì)胞數(shù)據(jù)細(xì)胞周期效應(yīng)造成的影響
unwanted sources of variation: 1.線粒體基因的干擾2.細(xì)胞周期基因的干擾 seurat 包里有clear out...
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單細(xì)胞文庫構(gòu)建（library construction）
自從19年3月份的一篇 comprehensive summary ：Benchmarking Single-Cell RNA Sequenci...