寫在前面 前天，我寫了一個(gè) TBtools 插件，意在讓所有人都能自主分析轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)，進(jìn)而獲得 基因表達(dá)量矩陣（TPM） 和 基因讀段計(jì)數(shù)矩陣（Count）。已經(jīng)提過(guò)了，...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：天津
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匯總 | 轉(zhuǎn)錄本表達(dá)矩陣 到 基因表達(dá)矩陣 -
上百個(gè)動(dòng)植物基因組組裝（華中農(nóng)已畢業(yè)的生物狗）的分析小經(jīng)驗(yàn)~不定時(shí)記錄日常搬磚踩坑記錄~<br>學(xué)無(wú)止境，溫故而知新~說(shuō)清楚問(wèn)題，有問(wèn)有回，禮貌的人才能得到回復(fù)
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生信技能樹(shù)，生信菜鳥(niǎo)團(tuán)，jimmy
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小號(hào)請(qǐng)關(guān)注——生信教學(xué)網(wǎng)
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生物信息學(xué)的本質(zhì)是挖掘大數(shù)據(jù)信息以獲取有用信息，對(duì)我們科研工作者來(lái)說(shuō)，需要更為直接的將生物信息學(xué)融入科研過(guò)程中，并加入我們的對(duì)生信結(jié)果的思考，最終獲取想要的信息。
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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整理生信工具內(nèi)容
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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生物信息學(xué)
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生信技能樹(shù)：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術(shù)文檔與博客，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者、愛(ài)好者以及相關(guān)編程人員加入本專題，貢獻(xiàn)你的文字，無(wú)論是原創(chuàng)還是筆記，我們需要你，將本專題打造為生信知識(shí)寶庫(kù)、交流平臺(tái)。 內(nèi)容可以是對(duì)生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒(méi)有被我收入專題，可能是我沒(méi)看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見(jiàn)諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過(guò)程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過(guò)程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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遺傳相關(guān)分子生物學(xué)技術(shù)
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種菜小王，常做實(shí)驗(yàn)，生信小白
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡(jiǎn)信不回答問(wèn)題，有問(wèn)題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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