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    機器學習(二)——線性回歸

    由于在之前有專門的文章介紹線性回歸,因此這里不在贅述。在這里稍微提一句:R語言是一種向量語言,為了獲得更好的性能,建議使用向量運算。因此一般情況下,for循環(huán)可以被一些映射函...

  • 機器學習算法:模型選擇與模型評估

    機器學習的目的是使學到的模型不僅對已知數(shù)據(jù),而且對未知數(shù)據(jù)都能有很好的預(yù)測能力。當損失函數(shù)給定時,基于損失函數(shù)的模型訓(xùn)練誤差(training error)和模型測試誤差(t...

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    GATK4插件Mutect2參數(shù)解析

    作者按 最近在準備著換一個職業(yè)賽道,所以在做之前所有項目的回溯,遇到了最最基礎(chǔ)的SNV+Indel的流程,給別人重新講了一遍Mutect2的過濾規(guī)則和參數(shù)選擇,發(fā)現(xiàn)這個,含金...

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    R語言主成分分析(PCA)加置信橢圓

    使用R語言為PCA散點圖添加置信區(qū)間,可以使用ggplot2,ggord去繪制。 使用R自帶數(shù)據(jù)集iris的前4列進行主成分分析,主要使用R的prcomp()基礎(chǔ)函數(shù)。 使用...

  • select值的長度超出了dissTOM行和列數(shù),要么是dissTOM沒賦值成功,要么是TOM計算的時候被自動舍棄了一部分基因,導(dǎo)致最終TOM維度小于原有總基因數(shù)

    WGCNA分析,簡單全面的最新教程

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  • 將非連續(xù)變量分別拆分成二元變量。即:假設(shè)當前非連續(xù)變量df$stage值為(stage i,stage ii,stage ii),拆解成三個二元變量df$stage_i值為(1,0,0,0...),df$stage_ii值為(0,1,0,0...),df$stage_iii值為(0,0,1,0...)

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