由于在之前有專(zhuān)門(mén)的文章介紹線性回歸，因此這里不在贅述。在這里稍微提一句：R語(yǔ)言是一種向量語(yǔ)言，為了獲得更好的性能，建議使用向量運(yùn)算。因此一般情況下，for循環(huán)可以被一些映射函...
發(fā)簡(jiǎn)信
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機(jī)器學(xué)習(xí)（二）——線性回歸 -
機(jī)器學(xué)習(xí)算法：模型選擇與模型評(píng)估
機(jī)器學(xué)習(xí)的目的是使學(xué)到的模型不僅對(duì)已知數(shù)據(jù)，而且對(duì)未知數(shù)據(jù)都能有很好的預(yù)測(cè)能力。當(dāng)損失函數(shù)給定時(shí)，基于損失函數(shù)的模型訓(xùn)練誤差（training error）和模型測(cè)試誤差（t...
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GATK4插件Mutect2參數(shù)解析作者按 最近在準(zhǔn)備著換一個(gè)職業(yè)賽道，所以在做之前所有項(xiàng)目的回溯，遇到了最最基礎(chǔ)的SNV+Indel的流程，給別人重新講了一遍Mutect2的過(guò)濾規(guī)則和參數(shù)選擇，發(fā)現(xiàn)這個(gè)，含金...
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R語(yǔ)言主成分分析（PCA）加置信橢圓使用R語(yǔ)言為PCA散點(diǎn)圖添加置信區(qū)間，可以使用ggplot2，ggord去繪制。 使用R自帶數(shù)據(jù)集iris的前4列進(jìn)行主成分分析，主要使用R的prcomp()基礎(chǔ)函數(shù)。 使用...
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select值的長(zhǎng)度超出了dissTOM行和列數(shù)，要么是dissTOM沒(méi)賦值成功，要么是TOM計(jì)算的時(shí)候被自動(dòng)舍棄了一部分基因，導(dǎo)致最終TOM維度小于原有總基因數(shù)
WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程
本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多。 WGC...
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將非連續(xù)變量分別拆分成二元變量。即：假設(shè)當(dāng)前非連續(xù)變量df$stage值為（stage i，stage ii，stage ii），拆解成三個(gè)二元變量df$stage_i值為（1,0,0,0...）,df$stage_ii值為（0,1,0,0...）,df$stage_iii值為（0,0,1,0...）
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生信技能樹(shù)，生信菜鳥(niǎo)團(tuán)，jimmy
