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240 發(fā)簡信
IP屬地:上海
  • @小潤澤 是這樣的,我有進行批次效應的去除,根據(jù)細胞來源不同設置了分組,現(xiàn)在我想看組間細胞的差異基因是否可以單獨提取細胞來做呢

    Seurat中FindMarker尋找兩個cell type差異基因的若干方法

    加載示例數(shù)據(jù) 1.運行Seurat 2.差異分析計算logFC值 其中:對象 cells cells包括兩種cell type的細胞barcodes(即每一個單獨的細胞)對象...

  • 請問題主,如果我想要比較同一個細胞類型中不同處理細胞之前的差異,我應該選擇哪一種方法呢?例如我想要比較Old_NSC 和 Young_NSC之前的差別。另外我一共有10w細胞,我發(fā)向將NSC類群單獨提取出來做FindMarkers和在整體Seurat對象中進行FindMarkers分析得到的結果不同,請問可能是什么原因呢?

    Seurat中FindMarker尋找兩個cell type差異基因的若干方法

    加載示例數(shù)據(jù) 1.運行Seurat 2.差異分析計算logFC值 其中:對象 cells cells包括兩種cell type的細胞barcodes(即每一個單獨的細胞)對象...

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