@小潤(rùn)澤 是這樣的，我有進(jìn)行批次效應(yīng)的去除，根據(jù)細(xì)胞來(lái)源不同設(shè)置了分組，現(xiàn)在我想看組間細(xì)胞的差異基因是否可以單獨(dú)提取細(xì)胞來(lái)做呢
Seurat中FindMarker尋找兩個(gè)cell type差異基因的若干方法加載示例數(shù)據(jù) 1.運(yùn)行Seurat 2.差異分析計(jì)算logFC值 其中：對(duì)象 cells cells包括兩種cell type的細(xì)胞barcodes（即每一個(gè)單獨(dú)的細(xì)胞）對(duì)象...
請(qǐng)問(wèn)題主，如果我想要比較同一個(gè)細(xì)胞類(lèi)型中不同處理細(xì)胞之前的差異，我應(yīng)該選擇哪一種方法呢？例如我想要比較Old_NSC 和 Young_NSC之前的差別。另外我一共有10w細(xì)胞，我發(fā)向?qū)SC類(lèi)群?jiǎn)为?dú)提取出來(lái)做FindMarkers和在整體Seurat對(duì)象中進(jìn)行FindMarkers分析得到的結(jié)果不同，請(qǐng)問(wèn)可能是什么原因呢？
Seurat中FindMarker尋找兩個(gè)cell type差異基因的若干方法加載示例數(shù)據(jù) 1.運(yùn)行Seurat 2.差異分析計(jì)算logFC值 其中：對(duì)象 cells cells包括兩種cell type的細(xì)胞barcodes（即每一個(gè)單獨(dú)的細(xì)胞）對(duì)象...
