南京大學(xué)生物學(xué)，佛系更新~
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腫瘤微環(huán)境在癌癥中的作用在過去數(shù)十年中，通過使用免疫療法、靶向療法和聯(lián)合方案，癌癥治療領(lǐng)域取得了前所未有的進(jìn)步。但這些治療方案中的絕大多數(shù)最終都無法治愈患者，甚至對(duì)治療有顯著初始反應(yīng)的腫瘤也經(jīng)常復(fù)發(fā)...
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【10X空間轉(zhuǎn)錄組Visium】（六）新版Seurat v3.2分析Visium空間轉(zhuǎn)錄組結(jié)果的代碼實(shí)操舊號(hào)無故被封，小號(hào)再發(fā)一次 更多空間轉(zhuǎn)錄組文章： 1. 新版10X Visium 【10X空間轉(zhuǎn)錄組Visium】（一）Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
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空間轉(zhuǎn)錄組教程|| stLearn ：空間軌跡推斷空間信息在空間轉(zhuǎn)錄組中的運(yùn)用[http://www.itdecent.cn/p/4804574c7838]Giotto|| 空間表達(dá)數(shù)據(jù)分析工具箱[https://www....
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人鱗狀細(xì)胞癌成分和空間結(jié)構(gòu)的多峰分析（空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞文章）目前10X空間轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)有了很多的意向，但是對(duì)于空間轉(zhuǎn)錄組的帶給我們的位置信息想要告訴我們什么樣的結(jié)果，仍缺乏引導(dǎo)，如何運(yùn)用空間轉(zhuǎn)錄組，更多需要我們自己的摸索和一些文獻(xiàn)帶給我...
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cellchat整合多個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞通訊分析Load the required libraries Create a directory to save figures Load CellChat object of ...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析CellChat之多樣本通訊差異分析hello，各位好，之前呢，我們分享了Cellchat的文章內(nèi)容，方法，以及單樣本分析案例，文章在10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之CellChat[https://...
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10X單細(xì)胞通訊分析之scMLnet（配受體與TF，差異基因（靶基因）網(wǎng)絡(luò)通訊分析）hi 各位，今天周五了，要開會(huì)的關(guān)系，沒有那么多時(shí)間準(zhǔn)備分享文獻(xiàn)了，但是我很想和大家分享這個(gè)方法，類似于多組學(xué)分析，配受體與TF分析聯(lián)合起來的網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果，非常有價(jià)值（配體...
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R package：理解Seurat的 S4類（二）以PBMC數(shù)據(jù)集進(jìn)行探索 1 載入所需要的包和文件夾 2 創(chuàng)建對(duì)象 Seurat通過CreateSeuratObject函數(shù)創(chuàng)建對(duì)象后，將我們導(dǎo)入的UMI count原始稀疏...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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醫(yī)學(xué)博士，目前就職于國內(nèi)五大腫瘤治療中心，R語言愛好者，熱衷于真實(shí)世界研究及生物信息學(xué)分析，合作請(qǐng)私信。
