發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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5.1.1 edgeR
樣本無(wú)重復(fù)與DESeq2的對(duì)比如下參考文章： http://www.itdecent.cn/p/517167c50a5f[https://ww...
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miRNA Realtime引物設(shè)計(jì)（莖環(huán)法）
成熟miRNA長(zhǎng)度在20bp左右，realtime合適的檢測(cè)長(zhǎng)度在80~150bp，因此需要在原有序列中增加莖環(huán)結(jié)構(gòu)，以延長(zhǎng)miRNA. 實(shí)驗(yàn)步...
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4.0 編碼能力鑒定參考文章： http://rna-cpat.sourceforge.net/[http://rna-cpat.sourceforge.net/]...
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3.0 轉(zhuǎn)錄本比對(duì)組裝HISAT2+StringTie+cuffcompareHISAT2 下載參考基因組：Sbicolor_454_v3.0.1.fa sbi301（Phytozome） StringTie 參考文章： ...
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免流量BLAST進(jìn)入郵箱，點(diǎn)擊郵件左側(cè)應(yīng)用欄，選擇科技云2020-12-23_LI.jpg 大數(shù)據(jù)平臺(tái)， 點(diǎn)擊進(jìn)入2020-12-23 (1).png 上方點(diǎn)擊...
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數(shù)據(jù)過(guò)濾
步驟：（0）perl 手動(dòng)去除第一行index六個(gè)堿基（1）去除低質(zhì)量的reads（質(zhì)量值Q≤19的堿基占總堿基的50%以上）；（2）默認(rèn)參數(shù)滑...
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環(huán)境準(zhǔn)備
更換系統(tǒng)：WSL+Ubuntu 替換鏡像源： 更新 安裝bioconda https://zhuanlan.zhihu.com/p/250855...