cor函數(shù)無(wú)法計(jì)算P值，有沒(méi)有可以計(jì)算P值的函數(shù)，謝謝各位
【R語(yǔ)言編程】---根據(jù)表達(dá)量計(jì)算mRNA與lncRNA的皮爾森相關(guān)系數(shù)前言：在構(gòu)建ceRNA 網(wǎng)絡(luò)時(shí)，需要計(jì)算lncRNA 與 蛋白編碼gene (pc gene） 間的表達(dá)相關(guān)性，一般采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)。具體如何做呢？ 首先獲得lncRNA...
您好，pvalueCutoff值感覺(jué)是根據(jù)p.adj截取的呢
GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個(gè)R包，可以用來(lái)做各種富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）、Reacto...
您好，我是初學(xué)者，目前也在做lncRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析，想咨詢一下采用gffcompare分類之后生成6個(gè)文件，采用哪一個(gè)文件進(jìn)行后面的lncRNA鑒定呢？謝謝您
擬南芥長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)鑒定的一個(gè)簡(jiǎn)單小例子鏈特異性文庫(kù)數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的論文 Identification and characterization of novel lncRNAs in Arabidopsis thali...
您好，我采用gffcompare分類的，獲得的tmap文件中FPKM和TPM值都為0，您知道是什么原因嗎？謝謝
lncRNA數(shù)據(jù)處理（get fasta>>>novel lncRNA))）情況說(shuō)明：我有兩個(gè)實(shí)驗(yàn)，每個(gè)實(shí)驗(yàn)兩個(gè)重復(fù)，我現(xiàn)在要鑒定到新的lncRNA之后進(jìn)行差異分析。大體思路，我會(huì)先通過(guò)常規(guī)的鑒定novel lncRNA方法鑒定到新的轉(zhuǎn)錄本，將轉(zhuǎn)錄本...
