發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山西
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worklog——pindel，GATK，delly使用pindel： 需要文件：sort過(guò)的bam文件；.fa的參考文件；config.txt文件（主要是用于標(biāo)準(zhǔn)化bam文件）；bam.bai文件；...
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學(xué)習(xí)——pindel,delly,GATK安裝
（一）pindel安裝 1)安裝htslib:git clonehttps://github.com/samtools/htslib https...
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學(xué)習(xí)——測(cè)序數(shù)據(jù)整理工作數(shù)據(jù)內(nèi)容：在腫瘤測(cè)序數(shù)據(jù)中，發(fā)現(xiàn)血系變異與體細(xì)胞變異的疊加 數(shù)據(jù)來(lái)源：TCGA 數(shù)據(jù)理解： ①TCGA數(shù)據(jù)產(chǎn)生過(guò)程： ②主要數(shù)據(jù)的分析: 數(shù)據(jù)操...
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學(xué)習(xí)——入門(mén)知識(shí)記錄1
目前基因測(cè)序工作中主要存在三個(gè)問(wèn)題： question1：精確控制問(wèn)題，其中主要是質(zhì)量控制問(wèn)題。 是由于目前基因測(cè)序中存在很多種算法，但是不同的...
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基因測(cè)序環(huán)境配置過(guò)程
安裝環(huán)境： ubuntu16.04 步驟一：安裝R語(yǔ)言 步驟二：安裝CloneVB_1.0.tar 步驟三：安裝samtloos 安裝地址：ht...