pindel： 需要文件：sort過的bam文件；.fa的參考文件；config.txt文件（主要是用于標準化bam文件）；bam.bai文件；.fa.fai文件將這些文件均...
發(fā)簡信
IP屬地：河北
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worklog——pindel，GATK，delly使用 -
學(xué)習(xí)——pindel,delly,GATK安裝
（一）pindel安裝 1)安裝htslib:git clonehttps://github.com/samtools/htslib https://github.com/g...
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學(xué)習(xí)——測序數(shù)據(jù)整理工作數(shù)據(jù)內(nèi)容：在腫瘤測序數(shù)據(jù)中，發(fā)現(xiàn)血系變異與體細胞變異的疊加 數(shù)據(jù)來源：TCGA 數(shù)據(jù)理解： ①TCGA數(shù)據(jù)產(chǎn)生過程： ②主要數(shù)據(jù)的分析: 數(shù)據(jù)操作規(guī)則（均只對一條數(shù)據(jù)的描述）...
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學(xué)習(xí)——入門知識記錄1
目前基因測序工作中主要存在三個問題： question1：精確控制問題，其中主要是質(zhì)量控制問題。 是由于目前基因測序中存在很多種算法，但是不同的算法都會產(chǎn)生不同的結(jié)果，面對這...
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基因測序環(huán)境配置過程
安裝環(huán)境： ubuntu16.04 步驟一：安裝R語言 步驟二：安裝CloneVB_1.0.tar 步驟三：安裝samtloos 安裝地址：http://www.010lm....
