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Orthovenn2，搭建屬于你的比較基因組學(xué)利器寫在前面 近期抽空基于OrthoVenn2給SapBase新增了一個比較基因組方面的模塊。OrthoVenn2可對多物種全基因組直系同源基因簇比...
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搭建PrimerServer2之Web UI界面寫在前面 引物設(shè)計幾乎是每個分子實驗室的研究生必備的一項技能。目前，已經(jīng)有許多成熟的引物設(shè)計軟件供大家使用，如本地版的Primer5以及NCBI...
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Connected Papers，豐富你的知識儲備寫在前面 近期考研分數(shù)已經(jīng)公布，9月份在各個科研領(lǐng)域又將注入一大波新鮮的科研血液。那么，初入茅廬的研究生新生，該如何快速并精確地掌握一個研究領(lǐng)域...
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什么？！聽說你還在用viroBlast搭建本地Blast網(wǎng)站？快換成美美噠SequenceServer！寫在前面 剛開始整數(shù)據(jù)庫的時候，用過viroBlast搭建Blast服務(wù)，詳見用viroblast搭建本地blast網(wǎng)站 - 簡書 (jians...
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震驚?。EGG官方工具能夠完成任何物種的KEGG注釋?。?！寫在前面 之前介紹過使用EggNOG-mapper對非模式物種快速完成KEGG注釋的推文https://mp.weixin.qq.com/s/k...
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初探GitBook寫在前面 碩士期間在折騰某些分析的時候，就發(fā)現(xiàn)好些軟件的操作文檔都是用GitBook寫的，并且掛到網(wǎng)上供用戶檢索與瀏覽，實在是方便而又簡潔好看 ...
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記錄NCBI下載基因組的大坑寫在前面 最近分析的物種由于國外品種與國內(nèi)品種差異還是比較大，雖然大部分文章用的參考基因組都是以國外品種為主，但是由于考慮到目前我這邊數(shù)據(jù)幾乎全...
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下載公共測序數(shù)據(jù)的另一種姿勢（kingfisher）寫在前面 一般在進行公共測序數(shù)據(jù)挖掘的時候，需要從公共數(shù)據(jù)庫中（SRA、ENA、DDBJ等）下載自己所需的測序數(shù)據(jù)。下載數(shù)據(jù)時，往往會遇到網(wǎng)速限...
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使用EGGNOG-Mapper對非模式物種快速進行GO或KEGG注釋對于非模式物種，需要做GO或KEGG富集，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來對你的物種序列進行快速注釋。在注釋結(jié)果文件中，可以同時獲得序列...