寫在前面 近期抽空基于OrthoVenn2給SapBase新增了一個比較基因組方面的模塊。OrthoVenn2可對多物種全基因組直系同源基因簇比較和注釋, 推薦安裝本地版,官...
軌跡分析系列: 單細胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析(Pseudot...
1.數(shù)據(jù)標準化 (1)標準化 (2)樣本總體分布 (3)樣本之間的相關性 2.差異表達分析 (1)limma包分析 (2)edgeR分析 (3)DESeq2分析 3.差異結果可視化
寫在前面 引物設計幾乎是每個分子實驗室的研究生必備的一項技能。目前,已經(jīng)有許多成熟的引物設計軟件供大家使用,如本地版的Primer5以及NCBI上的Primer-BLAST等...
軌跡分析系列: 單細胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細胞之軌跡分析-2:mono...
第七節(jié):空間轉錄組分析 在本節(jié)教程中,我們將學習空間轉錄組的一些分析方法。10X Visium平臺的空間轉錄組數(shù)據(jù)在許多方面是類似于scRNA-seq數(shù)據(jù)的,它包含5-20個...
前面介紹了利用Seurat對10x空間轉錄組數(shù)據(jù)單個樣本進行數(shù)據(jù)預處理、降維、聚類分析。今天來繼續(xù)分享怎么整合多個空間轉錄組樣本,同時進行聚類和分析marker基因。跟單細胞...
舊號無故被封,小號再發(fā)一次 更多空間轉錄組文章: 1. 新版10X Visium 【10X空間轉錄組Visium】(一)Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
寫在前面 近期考研分數(shù)已經(jīng)公布,9月份在各個科研領域又將注入一大波新鮮的科研血液。那么,初入茅廬的研究生新生,該如何快速并精確地掌握一個研究領域相關的知識呢?當然是通讀本領域...
寫在前面 剛開始整數(shù)據(jù)庫的時候,用過viroBlast搭建Blast服務,詳見用viroblast搭建本地blast網(wǎng)站 - 簡書 (jianshu.com)[https:/...