MLST(multilocus sequence typing):多位點序列分型CG( clonal group):克隆群CC(clonal c...
如果你已經(jīng)有一個模擬的馬爾可夫鏈序列,并且希望根據(jù)這些模擬數(shù)據(jù)估計轉(zhuǎn)移概率,可以使用頻率法或最大似然估計來計算狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)移概率。 1. 獲取模...
使用 sample_sequences = defaultdict(list) 和 sample_sequences = {} 創(chuàng)建字典有以下主...
我們知道conda在環(huán)境環(huán)境的時候一般采用的方法是: 但其實使用conda安裝環(huán)境并不限于create -n (或 --name)一種方法,還...
在擴增子建庫過程中,如果不加入PhiX文庫,而是在barcode(條形碼)位置增加幾個錯位堿基(即引入少量的隨機堿基),可以達到與加入PhiX文...
在計算置信區(qū)間時,使用引導法(Bootstrap)可以采用不同的抽樣方法。主要有兩種方式:總體數(shù)據(jù)的有放回抽樣和無放回抽樣。這兩種方法在計算引導...
一個 Git 倉庫常常有不同的分支,開發(fā)者可以在各個分支處理不同的特性,或者在不影響主代碼庫的情況下修復 bug。倉庫常常有一個 master ...
在 Git 中,當你新建了一個本地分支后,需要將該分支推送到遠端倉庫,以便其他協(xié)作者可以訪問該分支。以下是具體的步驟: 新建本地分支假設你已經(jīng)在...
阿里云服務器安裝 Centos 系統(tǒng)后使用 free 命令查看內(nèi)存大小往往會發(fā)現(xiàn)比所購買配置的標稱內(nèi)存要小很多,2G 內(nèi)存的查出來只有 1756...