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  • 你好奧,我想知道如何在IGV里把可視化正負(fù)鏈的峰,謝謝了

    鏈特異性建庫如何區(qū)分正負(fù)鏈?

    寫在前面的廢話 經(jīng)過這兩周意外的斷更,我明白了一個(gè)道理,人都是具有慣性的…… 兩周沒寫公眾號(hào),我似乎都習(xí)慣了懶惰,文章不想更了,筆記也懶得記了。 但是我沒忍住雙十一的誘惑,一...

  • 可否提供一下你的mm10.tss.bed文件?謝謝了

    ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)訓(xùn)練(三)

    ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)訓(xùn)練(三) 六、合并bam文件 在進(jìn)行peaks calling的時(shí)候,需要把bam進(jìn)行合并。 得到全新的bam文件如下: 假如需要去除PCR重...

  • 想知道你如何制備TSS的bed文件?

    高通量測序數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)記錄(四):DeepTools學(xué)習(xí)筆記

    前言 開題啦,所以需要整合自己之前處理過的數(shù)據(jù)包括可視化作圖,在GALAXY上翻到DeepTools正好有著一點(diǎn)用處,適當(dāng)?shù)母懔艘徊ㄊ虑?,順帶記錄一下。GALAXY上可以可視...

  • 如何獲得hg19.bed和小鼠mm10.bed文件,謝謝了

    Chip-seq 數(shù)據(jù)分析流程

    從GEO下載數(shù)據(jù) 下載地址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121424以第一個(gè)樣本GSM34361...

  • GISTIC2注冊(cè)不上呀

    TCGA 拷貝數(shù)變異(CNV)分析

    背景 查看某些基因在特定癌癥里是不是發(fā)生了拷貝數(shù)變異。 最簡單的方法 直接去一些分析網(wǎng)站上查看,當(dāng)然也有一些弊端,例如數(shù)據(jù)更新滯后,沒有給出明確的分析方法和判斷標(biāo)準(zhǔn)等,心中不...

  • 服務(wù)器上Rstudio的安裝(Rstudio-server)

    自己平常在用R/Rstudio本地處理數(shù)據(jù)或者畫圖時(shí),因數(shù)據(jù)量太大(電腦性能太差)而經(jīng)??ǖ牟恍?。前些天突然了解到原來在服務(wù)器上也可以裝Rstudio,其與本地電腦圖形化的界...

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