你好奧,我想知道如何在IGV里把可視化正負鏈的峰,謝謝了
鏈特異性建庫如何區(qū)分正負鏈?寫在前面的廢話 經(jīng)過這兩周意外的斷更,我明白了一個道理,人都是具有慣性的…… 兩周沒寫公眾號,我似乎都習慣了懶惰,文章不想更了,筆記也懶得記了。 但是我沒忍住雙十一的誘惑,一...
可否提供一下你的mm10.tss.bed文件?謝謝了
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓練(三)ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓練(三) 六、合并bam文件 在進行peaks calling的時候,需要把bam進行合并。 得到全新的bam文件如下: 假如需要去除PCR重...
想知道你如何制備TSS的bed文件?
高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄(四):DeepTools學習筆記前言 開題啦,所以需要整合自己之前處理過的數(shù)據(jù)包括可視化作圖,在GALAXY上翻到DeepTools正好有著一點用處,適當?shù)母懔艘徊ㄊ虑椋槑в涗浺幌隆ALAXY上可以可視...
如何獲得hg19.bed和小鼠mm10.bed文件,謝謝了
Chip-seq 數(shù)據(jù)分析流程從GEO下載數(shù)據(jù) 下載地址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121424以第一個樣本GSM34361...
GISTIC2注冊不上呀
TCGA 拷貝數(shù)變異(CNV)分析背景 查看某些基因在特定癌癥里是不是發(fā)生了拷貝數(shù)變異。 最簡單的方法 直接去一些分析網(wǎng)站上查看,當然也有一些弊端,例如數(shù)據(jù)更新滯后,沒有給出明確的分析方法和判斷標準等,心中不...
自己平常在用R/Rstudio本地處理數(shù)據(jù)或者畫圖時,因數(shù)據(jù)量太大(電腦性能太差)而經(jīng)常卡的不行。前些天突然了解到原來在服務器上也可以裝Rstudio,其與本地電腦圖形化的界...