發(fā)簡信
IP屬地：遼寧
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了解疫情防控工作方案，祝愿大家健康回家！
《冬春季農(nóng)村地區(qū)新冠肺炎疫情防控工作方案》 對農(nóng)村地區(qū)及返鄉(xiāng)人員 相關(guān)防疫工作進行部署 《方案》要求加強返鄉(xiāng)人員管理： 返鄉(xiāng)人員需持7天內(nèi)有效 新冠病毒核酸檢測陰性結(jié)果返鄉(xiāng)；...
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機器學習--有監(jiān)督--GBM(Boosting)集成學習(ensemble learning)是采用多個機器學習模型組合進行綜合預(yù)測，從而提升模型性能的思路，分為bagging與boosting兩種。之前學習的隨機森林便是...
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R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細節(jié)作者：白介素2相關(guān)閱讀：R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風險模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風險模型R語言生存分析-02-ggforestR...
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Graphpad Prism7 繪制分組箱線圖boxplot參考：GraphPad Prism 繪制箱形圖[http://paper.dxy.cn/article/515137]、如何用Graphpad Prism 8制作箱型圖[ht...
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技巧（2）——GraphPad Prism作圖|柱狀圖①【題外話】 說起作圖，就想起來本科階段遭遇的各種作圖窘境，其實就是簡單的單因素方差分析等，但是苦于不知道用什么軟件，然后就下載了一堆分析類軟件，比如SPSS，DPS，Exce...
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R語言ggplot2作圖好看的配色備選配色來源于論文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.nature.com/artic...
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【R語言】maftools包計算腫瘤突變負荷（TMB）相信很多小伙伴都聽過腫瘤突變負荷（tumor mutation burden, TMB），它是指腫瘤基因組去除胚系突變后的體細胞突變數(shù)量。定義為每百萬堿基中被檢測出的體細胞基...
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[富集分析] 3、clusterprofile富集分析--下游可視化1、富集分析的背景知識 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
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數(shù)據(jù)分析：基于DESeq2結(jié)果的基因富集分析介紹 DESeq2常用于識別差異基因，它主要使用了標準化因子標準化數(shù)據(jù)，再根據(jù)廣義線性模型判別組間差異（組間殘差是否顯著判斷）。在獲取差異基因結(jié)果后，我們可以進行下一步的富集...
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基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)
前面簡單介紹過基因矩陣轉(zhuǎn)置文件格式（* .gmt）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=26492005...
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Graphpad繪制森林圖：基本的原理也就是：提供數(shù)據(jù)生成主體（均值、區(qū)間、權(quán)重），圖表組件定制（量程、坐標軸、輔助線），圖表內(nèi)容結(jié)合： 森林圖：以無效線（橫坐標刻度為0或1）為中心，結(jié)合了數(shù)字、文本、...
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腫瘤變異數(shù)據(jù)分析和可視化工具maftools：突變數(shù)據(jù)下載和可視化本文接上次的內(nèi)容：《腫瘤變異數(shù)據(jù)分析和可視化工具maftools：安裝和文件格式要求[https://byteofbio.com/archives/4.html]》，本文以T...
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【R語言】蜂群圖+分位線+顯著性或p值前面給大家簡單介紹了 ? 【R】蜜蜂圖beeswarm[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%...
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2020-06-01 學習maftools : 可視化分析SNV（三）Customizing oncoplots clp 6/1/2020 加載包 讀入數(shù)據(jù) 0.1 Including Transition/Transversions into...
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TCGA數(shù)據(jù)庫MAF文件的分析以及可視化（maftools包的使用）這兩天“王院長”幫別人分析snv數(shù)據(jù)，順便給我推薦了一個R包：maftools。我看了一下官網(wǎng)，感覺是個非常強大的R包。那必須要學習起來~實際上網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程了，但都是用...
