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可移動原件--轉(zhuǎn)座transposition---耐藥毒力基因的轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)座是一類可以在基因組中移動位置的 DNA 片段，又被稱為“跳躍基因”. 它們最早是 20 世紀 40 年代 Barbara McClintoc...
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副流感病毒（HPIV）基因測序分型：從探針捕獲到基因型分析副流感病毒 HPIVs 基因組全長約為15.4~17.3 kb，不同血清型HPIVs基因組長度的差異主要來源于非編碼區(qū)序列長度的差異。 HPIV...
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諾如病毒選擇什么方法進行基因組測序？如何分型后期會在B站上更新視頻！ 諾如病毒（Norovirus）屬杯狀病毒科（Caliciviridae），正鏈單股RNA，基因組長度約 7.5–7.7...
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基因測序系統(tǒng)進化樹，有幾個SNP 才可以判斷同源？
Ai基因測序 盡管已有眾多案例表明WGS在病原菌分型與溯源中的優(yōu)勢，但在實際應(yīng)用中依舊面臨著眾多挑戰(zhàn)。例如，目前尚缺乏國際通用的細菌基因組數(shù)據(jù)采...
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評價病原微生物耐藥基因與藥敏實驗（耐藥表型）之間的相關(guān)性--Kappa系數(shù)耐藥基因我們常將耐藥基因制作成一張熱圖，看某一種微生物是否含有此耐藥基因?？倳幸环N想法，我們是否完全通過基因測序就能夠預(yù)測該病原的耐藥性呢？（...
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耐藥基因的獲得與熱圖構(gòu)建最近剛好寫了一篇關(guān)于耐藥基因相關(guān)分析的常規(guī)文章，分享一下最近的經(jīng)驗，方便大家借鑒參考我使用的是card,conda 安裝abricate工具，寫...
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病原微生物基因測序后的物種鑒定每次基因測序下機后似乎工作就已經(jīng)完成了，但是我這次測的對不對呢？我有沒有把樣本的順序弄錯了（我相信只要不是全自動的儀器，大家肯定都犯過錯，因為有...
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NCBI 介紹以及參考基因組SRA數(shù)據(jù)下載大全NCBI中常用到的數(shù)據(jù)功能：1.下載參考基因組 2.下載相關(guān)測序數(shù)據(jù)，構(gòu)建進化樹 1.下載參考基因組 https://www.ncbi.nlm....
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NextClade --病毒分析分型利器大家肯定都聽說過新冠病毒分型，像什么包括阿爾法、貝塔、德爾塔、奧密克戎變異株BA.2.12和BA.2.12.1。。。。這些分型是怎么來的？ 基因...