轉(zhuǎn)座是一類可以在基因組中移動位置的 DNA 片段,又被稱為“跳躍基因”. 它們最早是 20 世紀(jì) 40 年代 Barbara McClintock 在玉米上發(fā)現(xiàn)的——帶有轉(zhuǎn)座...
轉(zhuǎn)座是一類可以在基因組中移動位置的 DNA 片段,又被稱為“跳躍基因”. 它們最早是 20 世紀(jì) 40 年代 Barbara McClintock 在玉米上發(fā)現(xiàn)的——帶有轉(zhuǎn)座...
副流感病毒 HPIVs 基因組全長約為15.4~17.3 kb,不同血清型HPIVs基因組長度的差異主要來源于非編碼區(qū)序列長度的差異。 HPIVs基因組從3′到5′端依次編碼...
后期會在B站上更新視頻! 諾如病毒(Norovirus)屬杯狀病毒科(Caliciviridae),正鏈單股RNA,基因組長度約 7.5–7.7 kb,帶多聚腺苷尾(poly...
Ai基因測序 盡管已有眾多案例表明WGS在病原菌分型與溯源中的優(yōu)勢,但在實(shí)際應(yīng)用中依舊面臨著眾多挑戰(zhàn)。例如,目前尚缺乏國際通用的細(xì)菌基因組數(shù)據(jù)采集與分析的標(biāo)準(zhǔn)化流程,尤其是學(xué)...
耐藥基因我們常將耐藥基因制作成一張熱圖,看某一種微生物是否含有此耐藥基因??倳幸环N想法,我們是否完全通過基因測序就能夠預(yù)測該病原的耐藥性呢?(如果能實(shí)現(xiàn)的話一定是通過人工智...
最近剛好寫了一篇關(guān)于耐藥基因相關(guān)分析的常規(guī)文章,分享一下最近的經(jīng)驗(yàn),方便大家借鑒參考我使用的是card,conda 安裝abricate工具,寫了個腳本,對60個菌株fast...
每次基因測序下機(jī)后似乎工作就已經(jīng)完成了,但是我這次測的對不對呢?我有沒有把樣本的順序弄錯了(我相信只要不是全自動的儀器,大家肯定都犯過錯,因?yàn)橛腥祟惖牡胤?,就會有錯誤,但是錯...
NCBI中常用到的數(shù)據(jù)功能:1.下載參考基因組 2.下載相關(guān)測序數(shù)據(jù),構(gòu)建進(jìn)化樹 1.下載參考基因組 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dataset...
大家肯定都聽說過新冠病毒分型,像什么包括阿爾法、貝塔、德爾塔、奧密克戎變異株BA.2.12和BA.2.12.1。。。。這些分型是怎么來的? 基因組序列的差異通過比對不同病毒株...
Nextflow Nextflow 由 Paolo Di Tommaso 于 2013 年開發(fā),他是一位計(jì)算生物學(xué)家和軟件工程師。當(dāng)時 Paolo Di Tommaso 在巴...
docker相較于conda做生信分析有很多優(yōu)勢,尤其是在生信流程的搭建,多系統(tǒng)的支持移植性。但Docker學(xué)習(xí)難度有點(diǎn)高,需要花時間來學(xué)習(xí)。對于小白來說,初次安裝肯定是很困...
很多人肯定很苦惱,自己的電腦是window系統(tǒng),很多生信軟件不支持window系統(tǒng),這種情況下只能利用虛擬機(jī)裝一個完整的Linux系統(tǒng),虛擬機(jī)又很吃系統(tǒng)資源,今天給大家介紹一...
1. 什么是Linux操作系統(tǒng)? Linux是一種開源的操作系統(tǒng),最初由Linus Torvalds于1991年發(fā)布。與其他操作系統(tǒng)(如Windows和macOS)不同,Li...
思路 第一步你們的核苷酸有多相似(初步判斷) 拿到病原微生物基因測序的結(jié)果,先從宏觀上可以看一下他們的相似性--盲人摸象,給了你一個大腸桿菌的基因組和一個金黃色葡萄球菌的基因...
最近有點(diǎn)忙,更新的較少 今天主要介紹霍亂弧菌基本特點(diǎn)以及基因結(jié)構(gòu)以及NGS測序后續(xù)分析方法 先看下霍亂弧菌的生物學(xué)分類: 域(Domain):細(xì)菌域(Bacteria) 界(...
接著上一個視屏講,很多人說代碼的輸出結(jié)果看不懂,今天詳細(xì)聊一下 今天選擇了11個沙門菌進(jìn)行聚類分析,最終構(gòu)建進(jìn)化樹 聚類(Cluster)分析顧名思義就是指將研究的對象進(jìn)行分...
人工智能在代碼編寫方面已經(jīng)有很大的編寫能力,我就把自己的一些使用分享給大家(chatgpt使用需要tizi,最后放了chatgpt鏡像) 推薦大家使用kimi(國產(chǎn)的人工智能...
1.參考基因組,基因注釋之間的關(guān)系 參考基因組是指完成了測序和組裝的完整基因組序列,常寫在fasta文件中(后面我們聚類分析需要用到參考基因組) 但這些fasta文件簡直就是...