BIG小碩一枚<br>感興趣生命健康大數(shù)據(jù)和各種組學(xué)分析
IP屬地：遼寧
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生物信息學(xué)愛好者，可關(guān)注WeChat Public Platform：BioDataX
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R language
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用TCGAbiolinks從TCGA數(shù)據(jù)下載到下游分析的學(xué)習(xí)筆記
前言 之前一直在用RTCGA包下載數(shù)據(jù)，看著永不更新的數(shù)據(jù)，心里總覺(jué)得怪怪的，于是下定決心重新學(xué)習(xí)一個(gè)好用的包——TCGAbiolinks。這個(gè)包調(diào)用GDC的API，應(yīng)該是最...
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不常上線，有事可以找@547的小書童呀
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周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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簡(jiǎn)書是我在學(xué)習(xí)別人東西的過(guò)程中記筆記的地方，以便自己不斷查閱復(fù)習(xí)，同時(shí)通過(guò)不斷的輸出來(lái)暴露自己的短處從而不斷的進(jìn)步。大家留言問(wèn)的問(wèn)題我都看到了，沒(méi)有回復(fù)是因?yàn)樽约簩W(xué)藝不精不能準(zhǔn)確答復(fù)，望諒解~
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒(méi)有被我收入專題，可能是我沒(méi)看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過(guò)程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過(guò)程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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QQ：28720864
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生信技能樹，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
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分子模擬和基因組學(xué)大雜燴，我們是生物信息愛好者，開源，共享盡在生信雜談~ 請(qǐng)關(guān)注微信公眾號(hào)生信雜談（xiaoddrz）獲取更多原創(chuàng)精彩內(nèi)容！<br>若您只是做基因的可以通過(guò)右側(cè)文集篩選文章
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Happy unbirthday.
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