IP屬地：河南
-
A paper A Week-2021-12-27大家好，本周給大家分享的是一篇2020年9月17日發(fā)表在nature communication上使用ATAC-seq實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)探究牛胚胎染色質(zhì)重...
-
A Paper A Week 2021-10-11大家好，本周給大家分享的是一篇2020年6月2日發(fā)表在Cell Host and Microbe上使用比較基因組學(xué)解析毛螺菌科分離株之間的功能和...
-
2020-08-17
Mantel test 分析兩個(gè)距離矩陣之間的相關(guān)性 做微生物菌落少不了分析環(huán)境因子（pH，有機(jī)碳，總氮，鹽度等）與菌落的相關(guān)性，此時(shí)便需要做C...
-
第八章 單變量群落分析我們將微生物群落組成研究分為兩個(gè)主要部分：(1)分類多樣性、OTUS和類群的假設(shè)檢驗(yàn)；(2)類群間差異分析。第一個(gè)成分主要屬于單變量群落分析。第...
-
第九章 多變量群落分析2步驟1：以適當(dāng)?shù)母袷郊虞d和讀取OTU表：設(shè)置目錄的方式與我們?cè)谇皫渍轮兴龅南嗤??！皌d_OTU_tag_mapped_lineage.txt”...
-
第十章 微生物組數(shù)據(jù)的成分分析10.1 Introduction to Compositional Analysis（成分分析導(dǎo)論） ①什么是成分?jǐn)?shù)據(jù)？ 根據(jù)韋伯斯特第二版新...
-
第九章 多變量群落分析1微生物群落研究的主要目標(biāo)是比較不同群落的組成(β多樣性)。在第6章介紹了β多樣性，并舉例說明了如何計(jì)算β多樣性指數(shù)。得到β多樣性指數(shù)后，可以對(duì)其...
-
第七章 微生物組數(shù)據(jù)的探索性分析.2Redundancy Analysis (RDA)：與三種基本排序方法相對(duì)應(yīng)，vegan包有三種版本的約束排序：冗余分析(RDA，與主成分分析相...
-
第七章 微生物組數(shù)據(jù)的探索性分析.1微生物群落組成的研究方法可以分為兩大類：分類多樣性分析和微生物群落組成的多元分析。多變量分析包括各種多變量技術(shù)，如聚類和(無約束和有約束的)排序...