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240 發(fā)簡信
IP屬地:廣東
  • 可以直接將 perl 腳本的第一行改為: #!/usr/bin/env perl
    這樣對conda 虛擬環(huán)境比較方便。

    軟件包里的所有 perl 腳本,都需要這樣修改:
    cd /path/to/gmes_linux_64_4
    for i in *.pl; do sed -i '1c #!/usr/bin/env perl' $i; done

    安裝GeneMark-ET遇到的錯誤

    在安裝GeneMark-ET軟件時:一直卡在以下錯誤中 Can't locate Hash/Merge.pm in @INC (you may need to install...

  • 樓主您好,好像最后的結(jié)果不顯著?

    「Bioconductor」再次提醒,研究植物的不要輕易相信你用的注釋包

    有人說Y叔的clusterpofiler的GO注釋結(jié)果和其他工具不一樣,后來詢問,發(fā)現(xiàn)分析物種是擬南芥。這就讓我想起了我之前的一篇文章,「Bioconductor」不要輕易相...

  • 樓主的地圖,直接把 藏南地區(qū) 劃給了印度了。

    R語言之?dāng)?shù)據(jù)可視化---地圖可視化leaflet包(下)

    包的github鏈接地址:https://github.com/rstudio/leaflet基于leaflet的中文擴(kuò)展包出自chiffon大大github地址:https...

  • 120
    溯祖理論(coalescent theory):Fisher-Wright模型以及中性溯祖

    參考文獻(xiàn):Yang Z. 2014. Molecular evolution: a statistical approach. Oxford(England): Oxford...

  • 我今天也在看這個k-mer分析:joy::joy:

  • R語言格式化百分比數(shù)據(jù)

    (一)通過函數(shù)實(shí)現(xiàn)百分比格式化 # 百分比格式化 format_percnet <-function(x){return(paste0(format(x*100,digits...

  • 樓主,circos 在定義自己的顏色的時候,顏色命名不需要包含特殊字符,如-7-div等,那個是給Brewer 識別顏色數(shù)量和類型的。

    <colors>
    mycolors = mycolors-(\d+)
    mycolors-rev = rev(mycolors-(\d+))
    mycolors-1 = 252,234,236
    mycolors-2 = 248,204,208
    mycolors-3 = 244,174,180
    mycolors-4 = 240,144,152
    mycolors-5 = 236,144,124
    mycolors-6 = 233,84,96
    mycolors-7 = 229,54,68
    mycolors-8 = 220,29,44
    mycolors-9 = 190,25,38
    mycolors-10 = 160,21,32
    mycolors-11 = 130,17,26
    mycolors-12 = 100,13,20
    mycolors-13 = 70,9,14
    mycolors-14 = 40,5,8
    </colors>

    如何自定義circos圖的配色

    1.先來認(rèn)識一下circos的配色體系 下載安裝circos之后,在安裝目錄下面有一個png圖片,上面顯示的是circos支持的配色和字體樣式。 在繪圖過程中如何調(diào)用顏色?我...

  • 是因?yàn)轭A(yù)編譯的分類器 的問題麼? 我在TEClass 的readme 中,看到說,如果是自己構(gòu)建分類器,-p 默認(rèn)是1 個核心,所以不清楚TEClass 官網(wǎng)上預(yù)編譯的分類器在編譯的時候,是調(diào)用了幾個核心呢?

    ps. 我們服務(wù)器只有32個核心。

    使用TEclass對TE一致性序列進(jìn)行分類

    軟件安裝 軟件地址在http://www.compgen.uni-muenster.de/tools/teclass/index.hbi?, 由于TEclass這個軟件已經(jīng)許...

  • 多謝樓主分享。我在使用TEclass 的時候, 程序會意外退出,并提示core dumped,不知是不是需要在哪里指定線程數(shù)目呢?

    使用TEclass對TE一致性序列進(jìn)行分類

    軟件安裝 軟件地址在http://www.compgen.uni-muenster.de/tools/teclass/index.hbi?, 由于TEclass這個軟件已經(jīng)許...

  • 哈哈,謝謝老哥。也感謝李恒大神寫的軟件。

    引用:好簡單的一條命令,用perl寫腳本處理要好多行,下面??是我用perl寫的。
    其實(shí)是因?yàn)樽髡咭呀?jīng)把很多命令封裝到了 bioawk 里面了,所以調(diào)用才只需要一行命令。老哥你也可以把自己的perl 腳本寫成模塊,然后直接用perl去調(diào)用,也是只有一行命令。

    哈哈

    一個神奇的小軟件bioawk

    劉小澤寫于18.7.29 寫在前面:之前介紹過文本處理的三劍客,grep、sed、awk,也曾說過,學(xué)了awk,讓一切字符秒變尷尬“awk word”。其中的awk可以說是獨(dú)...

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