發(fā)簡信
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python學習：同一GeneID對應GO號排一行將GeneID與GO號一一對應的兩列表格，轉換為同一GeneID對應GO號排一行（如圖），主要使用字典、列表完成轉換。 代碼如下
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學習Linux的循環(huán): 批量blast
最常用的Linux循環(huán)應該是for和while，記錄兩個直接輸入command的實例（輸出Ta開頭的所有文件名字）： 開始正片：使用同一個que...
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python學習：primer3-py批量設計引物
100天生信-Day11 最近一直在做濕實驗，需要大量設計引物，發(fā)現(xiàn)primer3有python版本，可以批量設計，簡直神器。 參考教程：htt...
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ChIP-seq之上游workflow
100天生信-Day10 記錄一下workflow
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ChIP-seq之fastp質控+過濾
100天生信-Day9 所有高通量測序的下機數(shù)據(jù)一般都要進行質控，檢測數(shù)據(jù)質量，并去除低質量reads。之前比較常用的是fastQC質控 + c...
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R可視化之ggplot2繪制boxplot
100天生信-Day8 箱線圖繪制代碼記錄：
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ChIP-seq之samtools簡單命令
100天生信-Day7 ChIP-seq拉下來的reads經(jīng)過mapping生成.sam文件，sam文件使用samtools轉bam，再sort...
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R數(shù)據(jù)處理之長寬數(shù)據(jù)轉換
100天生信-Day6 長數(shù)據(jù)和寬數(shù)據(jù)是滿足不同分析的兩種數(shù)據(jù)格式，可以很方便用R的reshape2包轉換，代碼如下： 參考教程：https:/...
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ChIP-seq之MACS2進行peakcalling
100天生信-Day5 ChIP-seq、ATAC-seq等需要在全基因組上找到特定位置的結合/切割/富集的高通量測序技術，都需要進行reads...