寫在前面 早前已經(jīng)推過《新手eggNOG-Mapper詳細教程》，但仍然有很多人遇到使用問題。換句話，可能那個教程不能徹底解決大伙遇到的問題。于是我決定寫一個完美的教程，徹底...
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零基礎快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM... -
2023-12-23GO&KEGG富集分析eggNOG-mapper功能注釋eggNOG-mapper功能注釋 http://eggnog-mapper.embl.de/[http://eggnog-mapper.embl.de/] eggNOG (...
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E. coli ST1193比較基因組文章 標題：Phylogenetic Analysis Reveals Distinct Evolutionary Trajectories of the Fluoroqui...
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R packages：phyloseq（三） 16s 擴增子β多樣性分析導入數(shù)據(jù) PCoA 生成排序矩陣 碎石圖來查看排名前幾的軸的貢獻率 NMDS 非度量多維尺度分析
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R數(shù)據(jù)可視化: PCA和PCoA圖, 2D和3D前言 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也稱主分量分析或主成分回歸分析法，是一種無監(jiān)督的數(shù)據(jù)降維方法。PCA通過線性變換將原始...
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[R語言可視化-精美圖形繪制系列]--主成分分析（PCA）本期內(nèi)容為[R語言可視化-精美圖形繪制系列]--主成分分析（PCA） 主成分分析：PCA（Principal Component Analysis）是一種常用的數(shù)據(jù)分析方法。...
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R語言計算β多樣性指數(shù)及分析計算β多樣性指數(shù)需要用到phyloseq包。它的安裝方式不同于簡單的install.packages（“phyloseq”） 有兩種方法可以安裝 1.先安裝BiocManag...
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R語言：unifrac的計算
Unifrac是一個十分常用的衡量不同群落之間譜系結(jié)構(gòu)差異的指標。在R語言中，計算unifrac的函數(shù)不只一種，不同函數(shù)之間有什么差別呢？本文目的就是對幾個常用的計算unif...
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R：Bray-Curtis PCoA導讀 Bary-Curtis PCoA降維分析菌群結(jié)構(gòu)。 一、輸入數(shù)據(jù) 1.1 菌屬豐度矩陣 1.2 樣品分組 二、BC PCoA函數(shù) 三、分析及結(jié)果 3.1 結(jié)果文件 3....
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7. vegan包進行PCoA分析和可視化簡介 PCoA分析，即主坐標分析（principal co-ordinates analysis），是一種非約束性的數(shù)據(jù)降維分析方法，可用來研究樣本的相似性或差異性，與PCA...
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ggplot2繪制Alpha多樣性指數(shù)圖經(jīng)過前面幾節(jié)的原始數(shù)據(jù)處理過程，得到了可以用于分析的數(shù)據(jù)，現(xiàn)在讓我們開始微生物組數(shù)據(jù)分析可視化的第一步，繪制Alpha多樣性指數(shù)圖，喜歡的小伙伴歡迎關注個人公眾號R語言數(shù)據(jù)分...
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16S測序分析（六）用PICRUSt預測菌群KEGG代謝通路
導讀 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved S...
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16S測序分析（五）用RandomForest尋找關鍵細菌導讀 用隨機森林“分類”的方法尋找16S測序數(shù)據(jù)中與分組有關的細菌。 一、數(shù)據(jù)準備 標準化細菌豐度表格式要求：不用放樣本ID；最后一列放分組變量 二、R分析準備 三、隨機森林...
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SpringBoot+Vue前后端分離（CURD）Demo我發(fā)現(xiàn)我好久沒有更新了，寫一篇證明我還活著。既然是前后端分離的話，肯定是要有前端和后端的。這里前端我使用的Vue+ElementUI,后端采用的是SpringBoot+Myb...
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Vue3寫一個后臺管理系統(tǒng)（4）RBAC權(quán)限受控體系的實現(xiàn)一、RBAC 權(quán)限控制體系 要實現(xiàn)動態(tài)Menu，我們需要先來統(tǒng)一一下認知，明確項目中的權(quán)限控制系統(tǒng)。網(wǎng)上找了張圖，我們可以大致的看下 從圖中，我們可以簡單的這樣理解RBAC ...
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vue2.0 + element-ui 多級導航菜單自從用餓了么框架重構(gòu)項目以來，遇到 很多問題，我都有一一記錄下來，現(xiàn)在特喜歡這個框架，說實話，如果你是用了vue這個技術(shù)棧的話，一定要用餓了么的pc端框架哦，遇到問題的時候在...
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5. vue element-ui 后臺布局項目進行到后臺部分了，在這里整理下后臺導航欄菜單路由的跳轉(zhuǎn)詳解。 項目環(huán)境：項目環(huán)境：vue + vue-cli + element-ui 附最終效果圖： 1、整體布局 我這...