發(fā)簡信
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blast database
如何下載 NCBI NR NT數據庫？ 先了解BLAST Databases 1. Quick Start Get all numbered f...
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Short Read Aligners1、Shortread aligners are designed to find regions of high similarity，當匹配...
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序列比對與blast1、Global alignments 全局比對：盡可能保證兩條序列的堿基都能配對，因此會有比較多的錯配和gap，但是不會對序列兩端對gap進行...
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序列匹配與正則表達式一、grep，以行為處理單位，當數據是多行折疊時，行之間存在換行符，在行尾與下行行首間的模式用grep不能匹配，這時可用dreg或fuzznuc...
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測序與質控一、測序數據處理 1、bcl2fastq: converting the per-cycle base calls (stored in BCL...
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NCBI數據、獲取使用一、NCBI各類數據儲存庫 1、Sequence Read Archive (SRA)：raw sequence data and alignm...
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Biostar(3)
NCBI數據庫 NCBI編號的解釋 AC：一些可供選擇的注釋的基因組序列，主要用來標記病毒和原核生物。 AP：AC標記對應的蛋白產物。 ...
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Linux 常用命令（一）
一、使用幫助 1、Help：# help Command適用于內部命令；# Command --help/-h適用于外部命令。至于外部命令和內部...
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Biostar(2)
SET UP A MACos COMPUTER 一、首先分享幾個在跟隨書進行設置時出現的錯誤和解決辦法： 1、xcodebuild This p...