@榮_e687 你可以看看你的gene2go這張表里是不是有GO號(hào)不對(duì)
轉(zhuǎn)錄組分析(11) - GO/KEGG富集分析(1)簡(jiǎn)介 bioconductor介紹[http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/clusterProfil...
@榮_e687 你可以看看你的gene2go這張表里是不是有GO號(hào)不對(duì)
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定量都是用BAM文件
轉(zhuǎn)錄組分析(5) - 無(wú)參轉(zhuǎn)錄組拼接(illumina)目的 NGS測(cè)序得到的短序列(read)存儲(chǔ)于Fastq文件,在經(jīng)過(guò)DNA建庫(kù)和測(cè)序之后,文件中不同read之間的順序就全部丟失了。因此,F(xiàn)astq文件中緊挨著的兩條read...
1.下載frp 下載系統(tǒng)對(duì)應(yīng)的frp 安裝包[https://github.com/fatedier/frp/releases] 2.安裝jupyte 3.配置IP 端口 在...
對(duì)于沒(méi)有Org.Db的非模式生物,由于某些原因不制作Org.Db,然后利用clusterProfiler做富集 數(shù)據(jù)格式 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 富集分析繪圖
簡(jiǎn)介 bioconductor介紹[http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/clusterProfil...
@文藝眼鏡狗 conda是在shell
轉(zhuǎn)錄組分析(2) - 軟件安裝conda環(huán)境創(chuàng)建 conda create -n py3 python=3.8conda create -n py2 python=2.7 數(shù)據(jù)預(yù)處理軟件 conda ac...
真核生物大部分基因含有內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄完成后產(chǎn)生的mRNA前體需要經(jīng)過(guò)一系列復(fù)雜的加工,成為成熟的mRNA,轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)中才能發(fā)揮功能??勺兗艚樱ˋlternative Spli...
對(duì)比(Mapping)就是通過(guò)局部比對(duì)將短的reads定位到參考基因組上,以共后續(xù)分析使用。序列比對(duì)的過(guò)程包括:首先對(duì)參考基因組建立索引,建立索引之后,利用比對(duì)軟件將clea...
推斷統(tǒng)計(jì)是研究如何利用樣本數(shù)據(jù)來(lái)推斷總體特征的統(tǒng)計(jì)方法,其特點(diǎn)是根據(jù)速記的觀測(cè)樣本數(shù)據(jù)以及問(wèn)題的條件和假定,對(duì)未知事物作出的以概率形式表述的推斷。推斷性統(tǒng)計(jì)有四個(gè)理論部分:概...
假設(shè)總體的分布函數(shù)的類型已知,但是其中的一個(gè)或者多個(gè)參數(shù)未知,那么往往就需要對(duì)這些未知的參數(shù)做出合理的估計(jì),并且對(duì)所做出的估計(jì)進(jìn)行評(píng)價(jià),這樣的過(guò)程就叫做參數(shù)估計(jì)。參數(shù)估計(jì)是統(tǒng)...
推斷性統(tǒng)計(jì)學(xué)是用樣本(歷史數(shù)據(jù))的估計(jì)量(離散型或連續(xù)型)推斷總體(將來(lái))的對(duì)應(yīng)的參數(shù)值(離散型或連續(xù)型)。推斷性統(tǒng)計(jì)學(xué)有概率理論、抽樣理論、估計(jì)理論和假設(shè)檢驗(yàn)理論四個(gè)理論組...
一、基因家族基礎(chǔ)知識(shí)與研究思路介紹 1.基因家族簡(jiǎn)介 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域(內(nèi)含子外顯子啟動(dòng)子)。轉(zhuǎn)錄本才是基因的研究實(shí)體,轉(zhuǎn)錄本transcript(別名 ...
推斷統(tǒng)計(jì)是研究如何利用樣本數(shù)據(jù)來(lái)推斷總體特征的統(tǒng)計(jì)方法,其特點(diǎn)是根據(jù)速記的觀測(cè)樣本數(shù)據(jù)以及問(wèn)題的條件和假定,對(duì)未知事物作出的以概率形式表述的推斷。推斷性統(tǒng)計(jì)有四個(gè)理論部分:概...