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2021-07-13 R包安裝出錯與解決方法win10系統(tǒng) 剛裝好R和Rstudio，R版本為4.0.0時(shí)，需要安裝Rtools https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtool...
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錯誤提示：Error in structure(.External(.C_dotTclObjv, objv), class = "tclObj")
解決辦法：
$chooseCRANmirror(graphics=F)R包安裝出錯，提示package‘latticeExtra’isnotavailable(forRversion3.5.1) 的解決方法。(一個生信小白的血淚史)
最近疫情在家沒事就開始學(xué)習(xí)R語言，之前在安裝后加載包時(shí)很多都會提示有一些小包沒有安裝，這時(shí)候直接安裝小包就可以成功加載目的R包了～ 但是，在安裝DEseq2時(shí)出現(xiàn)了問題： 下...
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$ conda install bioconductor-deseq2
R包安裝出錯，提示package‘latticeExtra’isnotavailable(forRversion3.5.1) 的解決方法。(一個生信小白的血淚史)
最近疫情在家沒事就開始學(xué)習(xí)R語言，之前在安裝后加載包時(shí)很多都會提示有一些小包沒有安裝，這時(shí)候直接安裝小包就可以成功加載目的R包了～ 但是，在安裝DEseq2時(shí)出現(xiàn)了問題： 下...
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收藏貼-基因/蛋白功能注釋、富集分析在線工具詳解
Metascape網(wǎng)站（http://metascape.org ）是一個能對基因或蛋白質(zhì)列表進(jìn)行注釋和富集等分析的在線工具，除了傳統(tǒng)的GO注釋和富集之外還提供的蛋白質(zhì)互作分...
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R語言實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)——PPI可以用網(wǎng)頁版做，但有上限2000個基因的限制。所以今天開發(fā)一下怎么用R飛一波。 1. 下載STRING數(shù)據(jù)庫中蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò) 2. 下載Uniprot ID轉(zhuǎn)換文件 打開...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析R包seruat的版本比較
最近在用R學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析，讓我比較頭大的是seruat包，這個包的2.0+版本與3.0+版本差異真的很大。 參考視頻是bilibili上‘生信技能樹’的教學(xué)視頻，用的是...
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DESeq2差異基因分析和批次效應(yīng)移除差異基因鑒定 基因表達(dá)標(biāo)準(zhǔn)化 不同樣品的測序量會有差異，最簡單的標(biāo)準(zhǔn)化方式是計(jì)算counts per million (CPM)，即原始reads count除以總reads...
